58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1409 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1409    100 
 
 		 765 bp  1516    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  99.7 
 
 		 486 bp  650    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  99.09 
 
 		 795 bp  630  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  93.07 
 
 		 2967 bp  620  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  93.21 
 
 		 2967 bp  617  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  93.21 
 
 		 2967 bp  617  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  93.21 
 
 		 2967 bp  617  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  93.21 
 
 		 2967 bp  617  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  89.23 
 
 		 2967 bp  482  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  89.05 
 
 		 2970 bp  458  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  87.82 
 
 		 2967 bp  434  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6002    90.66 
 
 		 675 bp  412  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1575    90.66 
 
 		 1881 bp  412  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  89.76 
 
 		 2967 bp  389  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  89.46 
 
 		 1020 bp  381  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1297    89.46 
 
 		 1016 bp  381  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2143    89.46 
 
 		 444 bp  381  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  89.16 
 
 		 2895 bp  373  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3476    88.22 
 
 		 2978 bp  329  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  86.75 
 
 		 2967 bp  309  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  85.89 
 
 		 2973 bp  272  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  85.89 
 
 		 2973 bp  272  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15410    91.54 
 
 		 201 bp  264  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  9.49822e-18  unclonable  4.892999999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  84.98 
 
 		 2268 bp  248  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  84.98 
 
 		 2973 bp  248  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  84.98 
 
 		 2973 bp  248  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  84.98 
 
 		 2973 bp  248  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  84.98 
 
 		 2973 bp  248  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  84.98 
 
 		 2973 bp  248  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15420    94.53 
 
 		 165 bp  198  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  4.98117e-18  unclonable  4.51223e-22 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2295    88.39 
 
 		 1066 bp  165  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  82.04 
 
 		 2967 bp  159  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  82.04 
 
 		 2967 bp  159  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  79.67 
 
 		 1581 bp  157  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  86.88 
 
 		 2967 bp  151  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  86.62 
 
 		 2967 bp  145  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1488  hypothetical protein  90.08 
 
 		 168 bp  145  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0200539  normal  0.398384 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  86.62 
 
 		 933 bp  145  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0157    86.62 
 
 		 1755 bp  145  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336177  normal  0.717019 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  86.62 
 
 		 768 bp  145  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  86.62 
 
 		 612 bp  145  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  86.62 
 
 		 1821 bp  145  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  81.12 
 
 		 2970 bp  139  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  85 
 
 		 2967 bp  127  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  85 
 
 		 2967 bp  127  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0917    88.78 
 
 		 608 bp  107  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1040    89.25 
 
 		 1318 bp  105  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  83.12 
 
 		 3048 bp  103  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1120    87.63 
 
 		 811 bp  97.6  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  82.47 
 
 		 2958 bp  91.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  85.85 
 
 		 2967 bp  91.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  85.85 
 
 		 2967 bp  91.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  85.85 
 
 		 2967 bp  91.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3243  Tn3 family transposase  83.33 
 
 		 381 bp  63.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3995  Tn3 family transposase  83.33 
 
 		 381 bp  63.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1277  Tn3 family transposase  83.33 
 
 		 381 bp  63.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0914  hypothetical protein  84.81 
 
 		 162 bp  61.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4124  transposase Tn3  80.53 
 
 		 309 bp  50.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>