More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1076 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1076  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  693    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4060  hypothetical protein  74.32 
 
 
334 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.354383  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3405  hypothetical protein  74.32 
 
 
330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4699  hypothetical protein  70.53 
 
 
343 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0822  hypothetical protein  61.61 
 
 
375 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  48.32 
 
 
360 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  48.32 
 
 
356 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5132  hypothetical protein  45 
 
 
334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0124  twin-arginine translocation pathway signal  44.69 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  41.3 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.35 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  38.23 
 
 
321 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2519  hypothetical protein  41.08 
 
 
324 aa  229  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.3 
 
 
336 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.18 
 
 
330 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.62 
 
 
358 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 
331 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  40.12 
 
 
328 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  41.16 
 
 
322 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1829  hypothetical protein  38.7 
 
 
327 aa  222  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  38.58 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  36.68 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  38.33 
 
 
341 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  40.66 
 
 
340 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.6 
 
 
325 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  39.46 
 
 
330 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.6 
 
 
327 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  38.75 
 
 
332 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  34.95 
 
 
330 aa  215  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.56 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  39.38 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  40.48 
 
 
326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  38.83 
 
 
343 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1233  hypothetical protein  37.2 
 
 
379 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  36.39 
 
 
334 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.71 
 
 
328 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.19 
 
 
324 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  39.13 
 
 
323 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  35.97 
 
 
335 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.37 
 
 
330 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  39.53 
 
 
317 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  36.2 
 
 
327 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  39.53 
 
 
317 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  39.33 
 
 
330 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  38.74 
 
 
329 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  40.69 
 
 
330 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  38.87 
 
 
323 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2546  hypothetical protein  39.74 
 
 
324 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.530623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  39 
 
 
337 aa  205  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  36.67 
 
 
345 aa  205  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  38.64 
 
 
321 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  37.7 
 
 
333 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  36.67 
 
 
345 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  35.28 
 
 
328 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  38.36 
 
 
327 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.19 
 
 
349 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  39.06 
 
 
334 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.42 
 
 
332 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  38.49 
 
 
328 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  37.75 
 
 
329 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.18 
 
 
334 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.96 
 
 
328 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  36.07 
 
 
320 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  38.34 
 
 
322 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  37.05 
 
 
339 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  38.41 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  35.87 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  40.91 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.96 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  35.84 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  36.72 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  36.3 
 
 
341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  40.53 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  36.79 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  37.37 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  36.45 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  39.74 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  39.66 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.88 
 
 
328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.45 
 
 
334 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.56 
 
 
327 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  37.84 
 
 
334 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.33 
 
 
330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  39.6 
 
 
330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.33 
 
 
330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  35.35 
 
 
356 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  38.57 
 
 
330 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  35.84 
 
 
334 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  35.18 
 
 
324 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  34.66 
 
 
331 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  36.2 
 
 
327 aa  199  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  35.89 
 
 
344 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  35.37 
 
 
326 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  36.15 
 
 
304 aa  199  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  36.17 
 
 
351 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.25 
 
 
324 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  35.88 
 
 
331 aa  198  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  36.75 
 
 
331 aa  198  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  38.85 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>