More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4607 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  100 
 
 		 696 aa  1394    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 686 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4322  histidine kinase  36.31 
 
 		 636 aa  247  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.461598  normal  0.0714354 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 680 aa  213  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1024  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 682 aa  171  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000464711  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  26.02 
 
 		 795 aa  171  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.26 
 
 		 782 aa  163  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5379  histidine kinase  28.38 
 
 		 698 aa  155  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5380  histidine kinase  27.63 
 
 		 689 aa  153  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1256  histidine kinase  27.23 
 
 		 652 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 686 aa  151  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  35.45 
 
 		 586 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 463 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 802 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 656 aa  145  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 564 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  25.24 
 
 		 677 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  23.89 
 
 		 668 aa  144  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 511 aa  142  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  38.97 
 
 		 529 aa  142  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 535 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 535 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 510 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  39.83 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 528 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 535 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  36.08 
 
 		 496 aa  134  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  21.88 
 
 		 715 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.43 
 
 		 531 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 608 aa  128  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  33.98 
 
 		 387 aa  126  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  35.75 
 
 		 422 aa  126  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 763 aa  125  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  37.17 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 763 aa  125  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  34.39 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 679 aa  125  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  35.96 
 
 		 392 aa  124  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  34.51 
 
 		 402 aa  123  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 		 662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  34.38 
 
 		 311 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130107  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4666  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 514 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.782496  normal  0.233494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 816 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 708 aa  120  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 763 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 458 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  34.8 
 
 		 300 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 763 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  32.43 
 
 		 885 aa  118  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  35.22 
 
 		 392 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  34.93 
 
 		 502 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  35.22 
 
 		 392 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  35.86 
 
 		 435 aa  118  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  35.83 
 
 		 470 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 694 aa  118  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149051  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 307 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 592 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 448 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 		 799 aa  117  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  33.63 
 
 		 401 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 581 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 587 aa  117  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  34.78 
 
 		 392 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0377  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.04 
 
 		 673 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 300 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 377 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 644 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  34.91 
 
 		 397 aa  116  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  31.97 
 
 		 412 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  30.65 
 
 		 1355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  31.47 
 
 		 332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3414  diverse 7TM receptor, extracellular region 2  24.63 
 
 		 560 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 644 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6750  histidine kinase  33.23 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 321 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 446 aa  114  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000449051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4648  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 900 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 602 aa  114  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 359 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 634 aa  114  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 1291 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 591 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 473 aa  113  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 491 aa  114  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 682 aa  114  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 399 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0041  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 967 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.538382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3394  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 728 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.99137  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 1484 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 		 663 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  35.43 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  35.09 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 1516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  31.28 
 
 		 713 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  33.19 
 
 		 894 aa  112  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>