217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2266 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2266  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181453  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  41.67 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  41.67 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  40.43 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  35.68 
 
 		 233 aa  107  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  41.28 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  33.7 
 
 		 192 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  35.87 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  34.38 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  33.51 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  36.26 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  36.61 
 
 		 229 aa  99  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  39.13 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2913  flagellar L-ring protein  39.53 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  37.82 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  37.5 
 
 		 231 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  36.46 
 
 		 231 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  36.46 
 
 		 231 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  34.03 
 
 		 224 aa  94.7  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  36.96 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  32.95 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  37.57 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  34.05 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  31.65 
 
 		 238 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  35.15 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  36.76 
 
 		 240 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  34.52 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  36.41 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  36.42 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  36.99 
 
 		 221 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  37.64 
 
 		 231 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  38.01 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  34.52 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  33.74 
 
 		 223 aa  92  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  32.97 
 
 		 247 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  32.97 
 
 		 247 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  36.69 
 
 		 225 aa  91.3  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  34.15 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  35.56 
 
 		 230 aa  90.5  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  34.62 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  36.81 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  35.92 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  35.92 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  37.5 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  36.25 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  36.88 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  33.02 
 
 		 230 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  33.02 
 
 		 230 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  35.98 
 
 		 230 aa  89.4  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  32.47 
 
 		 224 aa  89  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1593  flagellar basal body L-ring protein  34.47 
 
 		 235 aa  88.6  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  33.51 
 
 		 244 aa  88.6  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0563  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 249 aa  88.6  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  38.06 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  32.52 
 
 		 232 aa  88.2  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  35.26 
 
 		 220 aa  88.2  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  34.32 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  37.58 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0048  flagellar L-ring protein  33.14 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.508164  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  32.2 
 
 		 261 aa  86.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  34.34 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  36.14 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  33.75 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  32.35 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  35.63 
 
 		 230 aa  85.5  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  35 
 
 		 229 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  32.95 
 
 		 227 aa  84.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  33.73 
 
 		 232 aa  84.3  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  33.73 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  31.64 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  32.94 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2592  flagellar basal body L-ring protein  33.5 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  35.19 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  31.41 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  28.89 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  35.71 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  32.29 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  34.38 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  26.94 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  32.18 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  35.71 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  35.26 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  34.47 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  35.47 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1874  flagellar basal body L-ring protein  33.5 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01075  flagellar L-ring protein precursor H  33.01 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  32.92 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1202  flagellar basal body L-ring protein  33.01 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  33.13 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01083  hypothetical protein  33.01 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1202  flagellar basal body L-ring protein  33.01 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1458  flagellar basal body L-ring protein  33.01 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.765592  hitchhiker  0.00069646 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2567  flagellar L-ring protein  33.01 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.089001  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2521  flagellar basal body L-ring protein  33.01 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937558  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  33.01 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2192  flagellar basal body L-ring protein  33.01 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  33.01 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.364365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>