More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0650 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0650  transcriptional regulator, response regulator  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000129  transcriptional regulator  71.78 
 
 		 220 aa  305  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000110935  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0500  transcriptional regulator  71.14 
 
 		 245 aa  303  8.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000138983  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05736  positive response regulator for pho regulon  70.65 
 
 		 220 aa  302  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0973  transcriptional regulator  47.98 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  43.06 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.4 
 
 		 235 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.57 
 
 		 233 aa  144  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  44.71 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.81 
 
 		 225 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  39.23 
 
 		 235 aa  143  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.3 
 
 		 219 aa  143  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1277  two component transcriptional regulator  41.83 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0649233  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.98 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  39.23 
 
 		 235 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.02 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.82 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  39.23 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  39.23 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  39.23 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  39.23 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  39.23 
 
 		 235 aa  141  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  39.23 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  39.23 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  39.23 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  39.23 
 
 		 235 aa  141  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  43.58 
 
 		 224 aa  141  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  41.14 
 
 		 223 aa  140  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  41.14 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  41.14 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  41.14 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.86 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  41.14 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  41.14 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  43.26 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  41.06 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  42.03 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0130  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  41.14 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 235 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  42.52 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.38 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  43.5 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.54 
 
 		 231 aa  138  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 229 aa  137  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  38.31 
 
 		 229 aa  137  7.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  38.54 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  39.6 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  39.9 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1961  phosphate regulon response regulator PhoB  40 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.09 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  39.07 
 
 		 236 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0226  DNA-binding response regulator  39.9 
 
 		 223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  40.76 
 
 		 233 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  38.68 
 
 		 235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  42.44 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.88 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.82 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  41.04 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  42.23 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.82 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  39.3 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  40.57 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.62 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0226  DNA-binding response regulator  39.41 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.42 
 
 		 230 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  35.92 
 
 		 229 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.24 
 
 		 227 aa  134  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5698  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.9 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  44.02 
 
 		 232 aa  134  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.61 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.69 
 
 		 231 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.38 
 
 		 230 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 241 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  39.9 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.29 
 
 		 237 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 225 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1539  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.58 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000287281  normal  0.103291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.64 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.9 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  38.35 
 
 		 236 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  37.98 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>