54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1394 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1394  hypothetical protein  100 
 
 		 530 aa  1107    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06886  hypothetical protein  41.01 
 
 		 177 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06885  hypothetical protein  44.22 
 
 		 152 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06887  protoporphyrinogen  55.88 
 
 		 129 aa  124  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  21.93 
 
 		 989 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  21.77 
 
 		 565 aa  75.1  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13759  oxidoreductase  22.75 
 
 		 602 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649685  normal  0.108342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2030  FAD dependent oxidoreductase  23.31 
 
 		 577 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2308  FAD dependent oxidoreductase  23.09 
 
 		 570 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231532  normal  0.0778846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  21.71 
 
 		 594 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2295  FAD dependent oxidoreductase  23.27 
 
 		 578 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  21.71 
 
 		 594 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  21.71 
 
 		 594 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  38.03 
 
 		 516 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  26.97 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  28.21 
 
 		 528 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  40 
 
 		 429 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  58.33 
 
 		 361 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  28.92 
 
 		 436 aa  47.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  25.98 
 
 		 432 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  32.98 
 
 		 438 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  34.33 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  35.21 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  47.83 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  25.08 
 
 		 460 aa  46.2  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  30.99 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  32.97 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  20 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  42.55 
 
 		 512 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  42.86 
 
 		 245 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  48.65 
 
 		 383 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  31.91 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  34.78 
 
 		 484 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  36.23 
 
 		 486 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  34.78 
 
 		 499 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  45.65 
 
 		 511 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  30.84 
 
 		 511 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  30 
 
 		 488 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  33.82 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  43.75 
 
 		 511 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 		 358 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0790  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  47.37 
 
 		 700 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  30.99 
 
 		 482 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  36.62 
 
 		 471 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  47.5 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  54.05 
 
 		 523 aa  43.5  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  34.78 
 
 		 486 aa  43.9  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0470  phytoene desaturase  29.06 
 
 		 496 aa  43.5  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  43.18 
 
 		 609 aa  43.5  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  24.05 
 
 		 488 aa  43.5  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  19 
 
 		 453 aa  43.5  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  41.07 
 
 		 484 aa  43.5  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>