87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0807 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  100 
 
 		 193 aa  393  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  68.36 
 
 		 181 aa  244  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  64.97 
 
 		 181 aa  239  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  61.45 
 
 		 183 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  60.96 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  57.87 
 
 		 183 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  57.87 
 
 		 183 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  57.87 
 
 		 183 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  57.06 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  59.44 
 
 		 189 aa  201  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  57.47 
 
 		 183 aa  195  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  55.37 
 
 		 184 aa  194  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  55.37 
 
 		 184 aa  194  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  55.37 
 
 		 183 aa  194  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  55.37 
 
 		 183 aa  194  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  55.37 
 
 		 183 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  55.37 
 
 		 183 aa  194  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  55.37 
 
 		 183 aa  194  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  55.37 
 
 		 183 aa  194  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  55.37 
 
 		 183 aa  194  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  57.4 
 
 		 183 aa  191  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  56.32 
 
 		 183 aa  191  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  53.8 
 
 		 183 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  52.27 
 
 		 183 aa  185  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  54.29 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  51.98 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  51.98 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  51.98 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  51.98 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  51.98 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  41.9 
 
 		 187 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  43.41 
 
 		 186 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.62 
 
 		 182 aa  147  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  48.88 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  45.71 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  44.87 
 
 		 174 aa  137  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  42.14 
 
 		 178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.79 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  38.92 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  39.77 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  35.9 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.82 
 
 		 186 aa  97.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  32.09 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.4 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  31.91 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.76 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  31.07 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  33.54 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  30.81 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  32.68 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.63 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  32 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  32.73 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.32 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.89 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  22.62 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  25.26 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.8 
 
 		 222 aa  47.8  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.13 
 
 		 232 aa  47.8  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  26.7 
 
 		 259 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.13 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  28.12 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.93 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.07 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.93 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  35.16 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.75 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  25.79 
 
 		 259 aa  45.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 163 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3460  phosphoesterase  27.27 
 
 		 243 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.16 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  25.73 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3480  metallophosphoesterase  26.94 
 
 		 243 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0474514  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.46 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  26.74 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  21.23 
 
 		 254 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.88 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  29.11 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  25.49 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3469  metallophosphoesterase  26.94 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  20.75 
 
 		 254 aa  42  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2142  metallophosphoesterase  32.93 
 
 		 218 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  30.25 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  31.15 
 
 		 177 aa  42  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.75 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.69 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  27.33 
 
 		 160 aa  41.2  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>