More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05735 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000128  signal transduction histidine kinase  91.33 
 
 		 484 aa  909    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000230722  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05735  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  978    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0499  sensor histidine kinase  72.52 
 
 		 499 aa  729    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000013599  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0651  membrane associated signal transduction protein,histidine kinase  56.78 
 
 		 491 aa  569  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0972  sensor histidine kinase  29.89 
 
 		 484 aa  196  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4362  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 587 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 763 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 587 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  27.14 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 318 aa  67  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.369985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  29.13 
 
 		 502 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2941  histidine kinase  28.83 
 
 		 318 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  26.03 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  26.54 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  28.37 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  25.64 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  24.89 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0489  Signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7070  histidine kinase  26.15 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4387  sensor histidine kinase  26.56 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 763 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 763 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2501  histidine kinase  27.05 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3977  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  26.05 
 
 		 751 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  27.27 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1072  histidine kinase  28.21 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4054  histidine kinase  26.81 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.44 
 
 		 468 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3154  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6329  histidine kinase  25.7 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00201026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472941  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1415  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 514 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 763 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3493  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 867 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.789076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  28.33 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0474  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 759 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.453015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0713  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 867 aa  62.4  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1305  sensor histidine kinase  26.46 
 
 		 514 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 592 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 897 aa  61.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 979 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 593 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 545 aa  60.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.595056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1878  sensor histidine kinase  26.27 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4210  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 612 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2823  histidine kinase  30.14 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 		 518 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.315276 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1146  two-component sensor  27.37 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 		 634 aa  60.5  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  26.91 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.53 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  25.13 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0208  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0149972  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1623  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0600  ATP-binding region, ATPase-like  30.28 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4359  ATPase domain-containing protein  26.7 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191758  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 493 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  27.78 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.73 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0629  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.67365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1450  histidine kinase  24.18 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4439  sensor histidine kinase  26.22 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46560  periplasmic sensory histidine protein kinase  28.5 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.744037  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3795  histidine kinase  30.62 
 
 		 610 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 		 707 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2590  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.413696 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5020  histidine kinase  24.27 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0920  histidine kinase  28.43 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.651175 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1136  two-component sensor  25 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0109  histidine kinase  25 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000786251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20811  Signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.861206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  27.6 
 
 		 667 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  29.15 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  24.91 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  26.22 
 
 		 712 aa  58.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1354  sensor histidine kinase  25.76 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0755  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 588 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.452305  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0291  helix-turn-helix, AraC type  27.32 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457062  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 594 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3618  histidine kinase  25.83 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.261667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>