More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000128 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0499  sensor histidine kinase  71.46 
 
 		 499 aa  722    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000013599  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05735  hypothetical protein  91.33 
 
 		 473 aa  909    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000128  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 484 aa  998    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000230722  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0651  membrane associated signal transduction protein,histidine kinase  55.79 
 
 		 491 aa  568  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0972  sensor histidine kinase  29.67 
 
 		 484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4362  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 587 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 587 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3154  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 501 aa  73.6  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  28.44 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2501  histidine kinase  29.27 
 
 		 501 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  27.62 
 
 		 471 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 533 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4387  sensor histidine kinase  26.74 
 
 		 500 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.57 
 
 		 468 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 763 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0755  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 588 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.452305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  26.92 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2714  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1072  histidine kinase  28.63 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  28.14 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  25.85 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 545 aa  64.7  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.595056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.623691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 816 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1894  histidine kinase  29.19 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0479288 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 618 aa  63.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  25.26 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6329  histidine kinase  25.7 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00201026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 979 aa  63.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.315276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1583  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 505 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0815903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35660  signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 572 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4439  sensor histidine kinase  25.78 
 
 		 376 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.369985  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  26.44 
 
 		 751 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  26.43 
 
 		 1885 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 634 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  25.43 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2941  histidine kinase  27.93 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  28.14 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  24.43 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 594 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 593 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 592 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 589 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  25.25 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1305  sensor histidine kinase  25.23 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179745  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 763 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0558  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.08 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3321  histidine kinase  26.06 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000784482 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 592 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 763 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1415  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.64 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  25 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  25.13 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0713  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 867 aa  60.5  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1292  histidine kinase  26.42 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00188773  hitchhiker  0.0000922476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2823  histidine kinase  29.68 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20811  Signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.861206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 584 aa  60.1  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021022  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3493  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 867 aa  60.1  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.789076  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1354  sensor histidine kinase  25.54 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3689  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.142231  normal  0.016382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3977  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  27.48 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4030  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 883 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 592 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 566 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  25.63 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1177  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 		 746 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0474  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 759 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.453015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.59 
 
 		 579 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 591 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  25.63 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>