More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0972 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0972  sensor histidine kinase  100 
 
 		 484 aa  991    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000128  signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 484 aa  199  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000230722  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05735  hypothetical protein  30.27 
 
 		 473 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0651  membrane associated signal transduction protein,histidine kinase  30.41 
 
 		 491 aa  190  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0499  sensor histidine kinase  31.75 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000013599  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.3 
 
 		 466 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  29.77 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.23 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  29.15 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 587 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 587 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4325  putative two-component system histidine kinase  29.38 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6794  Osmosensitive K channel His kinase sensor  31.9 
 
 		 891 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431431  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  23.83 
 
 		 482 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  27.4 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1560  ATPase domain-containing protein  28.92 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46560  periplasmic sensory histidine protein kinase  28.51 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.744037  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  27.78 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 524 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4232  ATP-binding region ATPase domain protein  25.84 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 763 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2605  ATP-binding region ATPase domain protein  25.84 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1100  histidine kinase  27.92 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2114  ATP-binding region ATPase domain protein  24.06 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 1383 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0217  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 454 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  25.48 
 
 		 347 aa  57  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03139  two component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  27.64 
 
 		 431 aa  57  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0742  histidine kinase  21.39 
 
 		 286 aa  57  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 604 aa  57  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2541  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 		 503 aa  57  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 718 aa  57  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  24.07 
 
 		 471 aa  57  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 461 aa  57  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2038  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.253762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2464  ATPase domain-containing protein  27.75 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.55 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 729 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  27.4 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  28.82 
 
 		 857 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 763 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 449 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.479222  normal  0.0168851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  28.82 
 
 		 477 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0937198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  25.96 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  26.07 
 
 		 423 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  26.78 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3147  sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0895878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 608 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1046  histidine kinase  26.94 
 
 		 489 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00874969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  29.46 
 
 		 921 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 465 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 550 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0936019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 524 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2063  ATPase domain-containing protein  29.72 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0356945  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1110  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 580 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0694  histidine kinase  23.61 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  25.87 
 
 		 592 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 454 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 		 657 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.83 
 
 		 468 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 383 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143908  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  27.1 
 
 		 527 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3391  histidine kinase  22.93 
 
 		 485 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0812164  normal  0.286483 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2189  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 729 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.49015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0755  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 588 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.452305  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  25.37 
 
 		 428 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0535  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 383 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.26 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  27.1 
 
 		 487 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4359  ATPase domain-containing protein  26.7 
 
 		 494 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191758  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  25.59 
 
 		 450 aa  54.3  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 730 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423858  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.79 
 
 		 770 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 470 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5872  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 485 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 300 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1513  Osmosensitive K channel His kinase sensor  29.65 
 
 		 832 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.919123  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  26.55 
 
 		 468 aa  54.3  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5024  histidine kinase  25.7 
 
 		 485 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168004  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  25.44 
 
 		 392 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4169  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.27 
 
 		 302 aa  53.9  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.429609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>