More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0651 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0651  membrane associated signal transduction protein,histidine kinase  100 
 
 		 491 aa  1021    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05735  hypothetical protein  56.78 
 
 		 473 aa  569  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000128  signal transduction histidine kinase  55.79 
 
 		 484 aa  568  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000230722  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0499  sensor histidine kinase  56.08 
 
 		 499 aa  557  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000013599  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0972  sensor histidine kinase  30.41 
 
 		 484 aa  190  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0202  ATP-binding region ATPase domain protein  26.91 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.331744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1864  ATPase domain-containing protein  23.95 
 
 		 371 aa  67  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 330 aa  67  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  28.57 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.36 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 594 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46560  periplasmic sensory histidine protein kinase  27.45 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.744037  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4362  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3742  sensor protein BasS/PmrB  26.46 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3608  sensor protein BasS/PmrB  26.46 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000312076  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0543  histidine kinase  28.51 
 
 		 288 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0596277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1437  Osmosensitive K channel His kinase sensor  26.91 
 
 		 854 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.429266  normal  0.268919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0208  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0149972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  25.76 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06169  histidine kinase  28.45 
 
 		 1225 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  27.67 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3506  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2541  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370181  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0172  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 1291 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 587 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 524 aa  60.5  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3459  histidine kinase  28.63 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  28.78 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2656  histidine kinase  28.63 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.265669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2918  Cache sensor hybrid histidine kinase  23.11 
 
 		 779 aa  60.1  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  26.69 
 
 		 469 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5351  histidine kinase  26.48 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4054  histidine kinase  25.21 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  26.13 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 587 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4207  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  25.45 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4359  ATPase domain-containing protein  25.46 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191758  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1177  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.22 
 
 		 746 aa  58.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14051  two-component sensor histidine kinase  27.78 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1072  histidine kinase  27.93 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3283  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 854 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331513  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 		 678 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00885051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  26.07 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  25.58 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  21.28 
 
 		 1334 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  24.88 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4991  Osmosensitive K channel His kinase sensor  26.92 
 
 		 920 aa  57.4  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 		 965 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  24.44 
 
 		 396 aa  57  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2754  histidine kinase  25.12 
 
 		 491 aa  57  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 488 aa  57  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 		 799 aa  56.6  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1019  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 858 aa  56.6  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0833425  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  24.65 
 
 		 589 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.71 
 
 		 768 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  25.47 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5544  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 420 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000556  signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  27.75 
 
 		 449 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 		 513 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 318 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.369985  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  27.45 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  27.27 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3977  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 433 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5020  histidine kinase  22.53 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  27.27 
 
 		 449 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  27.55 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4475  histidine kinase  24.55 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000400204 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0937  sensor histidine kinase  25.12 
 
 		 440 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000147175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>