More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_46560 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_46560  periplasmic sensory histidine protein kinase  100 
 
 
444 aa  827    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.744037  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  30.3 
 
 
430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  35.45 
 
 
442 aa  209  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  32.6 
 
 
448 aa  206  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
448 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  32.1 
 
 
447 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  32.68 
 
 
450 aa  204  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  32.46 
 
 
450 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  32.1 
 
 
447 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  32.1 
 
 
447 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 
451 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  32.82 
 
 
450 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  32.1 
 
 
447 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  32.1 
 
 
447 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0391  sensor histidine kinase  36.97 
 
 
445 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  32.67 
 
 
450 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  32.67 
 
 
450 aa  203  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  32.46 
 
 
450 aa  203  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  32.46 
 
 
450 aa  203  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  32.46 
 
 
450 aa  203  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  32.67 
 
 
450 aa  203  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  32.46 
 
 
450 aa  203  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  46.69 
 
 
471 aa  199  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  32.24 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2403  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
465 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  31.31 
 
 
446 aa  196  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2058  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
451 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  35.84 
 
 
433 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  28.67 
 
 
444 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  29.8 
 
 
436 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  31.45 
 
 
453 aa  189  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  31.54 
 
 
452 aa  189  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  31.39 
 
 
438 aa  189  9e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  30.49 
 
 
438 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  31.35 
 
 
453 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  30.65 
 
 
432 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  31.26 
 
 
470 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  30.41 
 
 
429 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  30.27 
 
 
438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  30.27 
 
 
438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  30.27 
 
 
438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  34.38 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  30.79 
 
 
438 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4620  osmolarity sensor protein  32.01 
 
 
459 aa  184  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  29.78 
 
 
436 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  30.27 
 
 
438 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  34.15 
 
 
439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  29.82 
 
 
438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  29.05 
 
 
440 aa  183  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.17 
 
 
453 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  29.6 
 
 
436 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
453 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  34.67 
 
 
437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  33.87 
 
 
453 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  30.6 
 
 
438 aa  176  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  33.26 
 
 
440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  33.04 
 
 
440 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  33.82 
 
 
449 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
427 aa  170  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
449 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  29.3 
 
 
438 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
438 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  32.05 
 
 
471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  33.33 
 
 
435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  32.03 
 
 
429 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
438 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  34.77 
 
 
430 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  33.57 
 
 
430 aa  161  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05130  osmolarity-sensing histidine protein kinase, EnvZ  38.69 
 
 
437 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
437 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.69504  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
438 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
439 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
437 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.33726 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
438 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
437 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  30.02 
 
 
523 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  34.49 
 
 
438 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4965  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226038 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
449 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
438 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  32.17 
 
 
500 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
449 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
439 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  35.93 
 
 
522 aa  150  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  34.31 
 
 
440 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
449 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 
446 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  35.94 
 
 
437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  35.94 
 
 
437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4298  histidine kinase  32.29 
 
 
428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  39.37 
 
 
391 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
421 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
440 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
440 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
462 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  35.26 
 
 
437 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>