More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1110 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  78.17 
 
 		 524 aa  764    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1110  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 580 aa  1150    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.68 
 
 		 763 aa  120  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 614 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.21 
 
 		 1162 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 725 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  34.01 
 
 		 903 aa  108  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 456 aa  107  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 613 aa  106  9e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  29.07 
 
 		 575 aa  106  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  30.36 
 
 		 857 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1465  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 895 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.113581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1564  histidine kinase  29.85 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 447 aa  103  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 489 aa  103  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  34.4 
 
 		 423 aa  103  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0300  Osmosensitive K channel His kinase sensor  35.86 
 
 		 850 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 614 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 		 889 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 		 953 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  30.77 
 
 		 591 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  33.91 
 
 		 346 aa  102  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 584 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 907 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  24.89 
 
 		 458 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0052  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 348 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 584 aa  100  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 585 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  33.88 
 
 		 927 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  24.89 
 
 		 458 aa  100  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 592 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  24.89 
 
 		 458 aa  100  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  32.47 
 
 		 476 aa  100  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  29.03 
 
 		 595 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  32.58 
 
 		 484 aa  99.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  24.44 
 
 		 458 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 889 aa  99.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 695 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  24.44 
 
 		 458 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  28.51 
 
 		 461 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2541  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 503 aa  100  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 592 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1908  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 487 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218614  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  30.45 
 
 		 728 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 392 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  35.18 
 
 		 363 aa  99.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 691 aa  99.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  24.89 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  26.03 
 
 		 502 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  24.89 
 
 		 458 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  24.44 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3764  histidine kinase  33.88 
 
 		 545 aa  99.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  32.42 
 
 		 596 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  30.7 
 
 		 437 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  24.44 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 640 aa  99  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 592 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 919 aa  99.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  28.1 
 
 		 461 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  34.14 
 
 		 535 aa  98.6  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 356 aa  98.6  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 2783 aa  98.6  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 		 678 aa  98.6  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 		 631 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3855  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 470 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 487 aa  98.2  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 442 aa  98.2  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  28.1 
 
 		 461 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 1043 aa  98.2  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  31.93 
 
 		 343 aa  98.2  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 1370 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  24.89 
 
 		 458 aa  97.8  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 348 aa  97.8  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000063575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  33.49 
 
 		 905 aa  97.8  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 		 934 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 342 aa  97.8  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 		 1297 aa  97.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  30.47 
 
 		 347 aa  97.4  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 		 1207 aa  97.1  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 348 aa  97.1  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  25.42 
 
 		 481 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 365 aa  97.1  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 582 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  28.76 
 
 		 742 aa  96.3  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3779  Osmosensitive K channel His kinase sensor  34.04 
 
 		 857 aa  96.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 634 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.38 
 
 		 1535 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 476 aa  96.3  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0060  sensor histidine kinase  30.64 
 
 		 348 aa  95.9  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  29.44 
 
 		 906 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 708 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 827 aa  95.9  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 571 aa  95.5  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 		 944 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  28.95 
 
 		 439 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  29.09 
 
 		 728 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 		 662 aa  95.5  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0056  histidine kinase  31.08 
 
 		 348 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>