More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05571 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  81.11 
 
 		 413 aa  714    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05571  sensory transduction protein kinase  100 
 
 		 413 aa  862    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0334  histidine kinase  62.77 
 
 		 418 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000559138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3010  histidine kinase A domain-containing protein  59.56 
 
 		 420 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728657  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  51.32 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0417  putative sensor kinase protein  57.29 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  26.03 
 
 		 425 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  26.18 
 
 		 405 aa  106  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  27.59 
 
 		 431 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  23.23 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  26.56 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  25.46 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  25.88 
 
 		 449 aa  99.8  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  23.13 
 
 		 423 aa  99.8  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  26.15 
 
 		 446 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  27.04 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  28.1 
 
 		 426 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  27.55 
 
 		 426 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 421 aa  93.2  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.89 
 
 		 422 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  25.97 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  26.47 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  26.55 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  26.61 
 
 		 422 aa  90.1  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  25.67 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  25.77 
 
 		 455 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 430 aa  87  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  25.67 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0692  histidine kinase A domain-containing protein  29.36 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  27.45 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3576  histidine kinase A domain-containing protein  27.88 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  24.59 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  25.5 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  27.19 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0147  signal transduction histidine kinase-like protein  26.84 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  24.28 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4195  histidine kinase A domain-containing protein  27.68 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3797  ATPase domain-containing protein  26.43 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.36 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4622  sensor histidine kinase  26.7 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  24.46 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  23.1 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4327  histidine kinase A domain-containing protein  27.23 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  23.91 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5573  sensor histidine kinase  26.52 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  26.87 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2105  sensor protein YgiY, putative  26.64 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000014063  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00327402  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00272877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2398  histidine kinase  26.42 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00201135  normal  0.0208658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  25.35 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  25.3 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6963  histidine kinase  24.48 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.20821  normal  0.0498309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4883  histidine kinase  27.09 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.876275 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1828  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0770919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1930  histidine kinase  25.91 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.53323  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3015  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307553 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1886  ATPase domain-containing protein  24.9 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367152  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 466 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3439  Signal transduction histidine kinase-like  20.62 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359307 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3911  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.697647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  23.32 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135956 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  26.1 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2713  histidine kinase  25.87 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2055  sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2074  histidine kinase  27.23 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.157607  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  25.27 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  22.46 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  24.14 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.14 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2038  ATP-binding region ATPase domain protein  23.5 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>