More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02132 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02132  vtamin B12-transporter permease  100 
 
 		 331 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003687  vitamin B12 ABC transporter permease component BtuC  92.45 
 
 		 337 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0864  vtamin B12-transporter permease  65.15 
 
 		 335 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2151  vtamin B12-transporter permease  50.61 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1828  vtamin B12-transporter permease  47.84 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1720  vtamin B12-transporter permease  47.84 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2616  vtamin B12-transporter permease  47.84 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.788864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  48.81 
 
 		 351 aa  262  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2005  vtamin B12-transporter permease  48.44 
 
 		 326 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.509358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1833  vtamin B12-transporter permease  48.44 
 
 		 326 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.342268  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1435  vtamin B12-transporter permease  48.44 
 
 		 326 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0354813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  48.44 
 
 		 326 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1468  vtamin B12-transporter permease  48.44 
 
 		 326 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1625  vtamin B12-transporter permease  48.81 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2775  vtamin B12-transporter permease  46.04 
 
 		 345 aa  242  7e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.574344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2469  vtamin B12-transporter permease  44.79 
 
 		 345 aa  242  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1920  vtamin B12-transporter permease  48.64 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1791  vtamin B12-transporter permease  48.64 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.979653  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01680  vtamin B12-transporter permease  48.81 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1931  transport system permease protein  48.81 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00205827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1479  vtamin B12-transporter permease  48.81 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.950653 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01669  hypothetical protein  48.81 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.028051  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1930  vtamin B12-transporter permease  48.81 
 
 		 326 aa  237  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2429  vtamin B12-transporter permease  48.81 
 
 		 326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1915  vtamin B12-transporter permease  48.3 
 
 		 326 aa  232  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1654  vtamin B12-transporter permease  46.03 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.81431  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  42.35 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  42.35 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  42.35 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  39.35 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  38.44 
 
 		 370 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  39.6 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  40.27 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  38.76 
 
 		 338 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  43.36 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  37.8 
 
 		 452 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  39.02 
 
 		 347 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  40.14 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  40.55 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  38.33 
 
 		 367 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  40.07 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  40.41 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  39.29 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  40.07 
 
 		 318 aa  179  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3240  transport system permease protein  41.46 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  39.12 
 
 		 365 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 		 342 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  36.68 
 
 		 344 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 		 342 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  37.95 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  38.1 
 
 		 370 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  41.9 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  37.28 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  36.33 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  39.59 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  36.89 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  40.07 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  39.02 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02205  putative hemin transport system permease transmembrane protein  40 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.788776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  40.07 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  38.1 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  39.79 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  42.61 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  39.79 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1211  transport system permease protein  40.27 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1016  transport system permease protein  39.72 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0947  transport system permease protein  39.72 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  39.79 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  34.53 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  34.53 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  34.53 
 
 		 345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  34.53 
 
 		 345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  38.18 
 
 		 361 aa  165  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  38.03 
 
 		 354 aa  165  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  33.93 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  33.53 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  34.29 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  32.82 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  37.81 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  36.72 
 
 		 345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3674  hemin ABC transporter, permease protein  38.1 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  35.89 
 
 		 355 aa  162  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2583  transport system permease protein  36.75 
 
 		 373 aa  162  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  32.51 
 
 		 348 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  37.68 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  38.31 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  36.58 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1489  transport system permease protein  35.13 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  33.33 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  36.77 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  36.39 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  35 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  35.84 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  36.9 
 
 		 363 aa  159  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  37.38 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  36.58 
 
 		 345 aa  159  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  34.86 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  32.19 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>