More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1654 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1654  vtamin B12-transporter permease  100 
 
 		 333 aa  633  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.81431  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1625  vtamin B12-transporter permease  78.01 
 
 		 333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2469  vtamin B12-transporter permease  73.93 
 
 		 345 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2775  vtamin B12-transporter permease  74.62 
 
 		 345 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.574344  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1720  vtamin B12-transporter permease  69.31 
 
 		 335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2616  vtamin B12-transporter permease  69.31 
 
 		 335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.788864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1828  vtamin B12-transporter permease  69.31 
 
 		 335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  64.55 
 
 		 351 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1435  vtamin B12-transporter permease  68.34 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0354813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1468  vtamin B12-transporter permease  68.34 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1833  vtamin B12-transporter permease  68.34 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.342268  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  68.34 
 
 		 326 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2005  vtamin B12-transporter permease  68.34 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.509358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2151  vtamin B12-transporter permease  66.36 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01680  vtamin B12-transporter permease  69.18 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1931  transport system permease protein  69.18 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00205827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1479  vtamin B12-transporter permease  69.18 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.950653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2429  vtamin B12-transporter permease  69.18 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01669  hypothetical protein  69.18 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.028051  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1930  vtamin B12-transporter permease  69.18 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1920  vtamin B12-transporter permease  68.75 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1791  vtamin B12-transporter permease  68.75 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.979653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1915  vtamin B12-transporter permease  68.44 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003687  vitamin B12 ABC transporter permease component BtuC  43.77 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0864  vtamin B12-transporter permease  46.83 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02132  vtamin B12-transporter permease  43.98 
 
 		 331 aa  235  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  42 
 
 		 370 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  43.06 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  42.6 
 
 		 347 aa  196  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  44.29 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  39.04 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  44.21 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  39.44 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  39.47 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  42.51 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.62 
 
 		 354 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  45.33 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  41.99 
 
 		 369 aa  183  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  42.32 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  42.41 
 
 		 318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  37.94 
 
 		 337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  40.73 
 
 		 345 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  41.26 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  41.7 
 
 		 334 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  41.7 
 
 		 334 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  41.7 
 
 		 334 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  40 
 
 		 315 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  37.41 
 
 		 355 aa  178  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  40.46 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  44.03 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3240  transport system permease protein  43.58 
 
 		 338 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  42.96 
 
 		 338 aa  176  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  40.86 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  37.13 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  40.42 
 
 		 351 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  36.12 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1211  transport system permease protein  44.24 
 
 		 329 aa  175  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  35.8 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  40.07 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  37.07 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  35.21 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 		 338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  35.21 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  35.21 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  35.21 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  35.08 
 
 		 368 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.35 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  40.54 
 
 		 334 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  40.96 
 
 		 356 aa  172  9e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  42.16 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2441  transport system permease protein  43.67 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00106696  normal  0.535476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  43.16 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  34.71 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  41.49 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  34.12 
 
 		 348 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  41.55 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  34.91 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  43.51 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  38.36 
 
 		 361 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  38.46 
 
 		 452 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  40.07 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  40.54 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  43.16 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3203  putative transmembrane ABC transporter protein,permease  39.75 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  37.16 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  39.73 
 
 		 326 aa  166  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1016  transport system permease protein  43.16 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  33.88 
 
 		 367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  40.51 
 
 		 325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  42.46 
 
 		 343 aa  165  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0947  transport system permease protein  42.81 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  38.38 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  37.11 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  42.29 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  39.45 
 
 		 361 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  32.65 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>