More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004174 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  100 
 
 		 275 aa  565  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  96.73 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  92 
 
 		 275 aa  529  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  82.55 
 
 		 275 aa  484  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  64.6 
 
 		 277 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  63.41 
 
 		 277 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  62.68 
 
 		 277 aa  367  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  62.77 
 
 		 277 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  63.6 
 
 		 279 aa  364  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  62.32 
 
 		 277 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  62.68 
 
 		 277 aa  363  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  63.24 
 
 		 279 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  63.24 
 
 		 279 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  59.42 
 
 		 276 aa  362  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  63.24 
 
 		 279 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  63.24 
 
 		 279 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  63.24 
 
 		 279 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  63.24 
 
 		 279 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  62.87 
 
 		 279 aa  360  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  62.87 
 
 		 279 aa  359  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  61.96 
 
 		 279 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  54.35 
 
 		 276 aa  325  7e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  53.28 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  54.04 
 
 		 275 aa  305  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  52.73 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  53.09 
 
 		 280 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  53.45 
 
 		 280 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  53.09 
 
 		 275 aa  292  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  52.73 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  51.09 
 
 		 278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  52.73 
 
 		 274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  50.91 
 
 		 275 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  50.55 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  50.55 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  50.55 
 
 		 275 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  47.23 
 
 		 278 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  49.63 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  47.08 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  47.1 
 
 		 275 aa  258  6e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  46.1 
 
 		 285 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  46.84 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  41.7 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  40.47 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  40.47 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  38.63 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  40.47 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  39.39 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  39.39 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  40.62 
 
 		 289 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 		 296 aa  194  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  39.43 
 
 		 414 aa  192  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  41.18 
 
 		 289 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  38.1 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  38.81 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  38.26 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  39.05 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  40.46 
 
 		 288 aa  188  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  39.84 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  39.69 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  37.12 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  38.64 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  38.58 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  37.76 
 
 		 292 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  37.31 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  36.26 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  35.53 
 
 		 276 aa  178  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  37.23 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  35.29 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  38 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  36.59 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  35.02 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  35.59 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  37.36 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  35.88 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  37.91 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  35.84 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  35.11 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  36.1 
 
 		 292 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  35.11 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  40.73 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  40.73 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  35.38 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.05 
 
 		 289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  37.82 
 
 		 316 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  35.46 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  33.81 
 
 		 291 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  34.05 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  36.53 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  39.52 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  38.71 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  37.4 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  36.4 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  34.05 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  37.88 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  34.96 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  37.88 
 
 		 303 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  39.15 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>