More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000638 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme beta subunit  100 
 
 		 324 aa  660    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3864  threonine dehydratase  51.8 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0056  threonine dehydratase  51.46 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595  hitchhiker  0.00751641 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  53.1 
 
 		 323 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  53.1 
 
 		 323 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  50.99 
 
 		 323 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4430  threonine dehydratase  51.17 
 
 		 330 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6018  threonine dehydratase  49.67 
 
 		 323 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  49.67 
 
 		 323 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6650  threonine dehydratase  53.1 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.987033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3469  threonine dehydratase  49.84 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2723  threonine dehydratase  54.29 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4376  ectoine utilization protein EutB  52.6 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2151  threonine dehydratase  51.62 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5519  threonine dehydratase  49.65 
 
 		 333 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0114285 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5240  threonine dehydratase  49.01 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3695  threonine dehydratase  47.39 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0285  threonine dehydratase  47.35 
 
 		 318 aa  227  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.832074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  39.3 
 
 		 402 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3798  hypothetical protein  39.94 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  37.7 
 
 		 402 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0008  hypothetical protein  39.94 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4146  hypothetical protein  39.61 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3175  threonine dehydratase  48.89 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.465407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  37.66 
 
 		 405 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  38.13 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  37.66 
 
 		 403 aa  209  4e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  37.19 
 
 		 403 aa  209  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  41.61 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  36.88 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  36.88 
 
 		 403 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  37.94 
 
 		 402 aa  205  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  37.54 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  37.66 
 
 		 509 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  35.26 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  36.89 
 
 		 402 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  37.05 
 
 		 403 aa  193  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  37.26 
 
 		 403 aa  192  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.31 
 
 		 332 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  37.41 
 
 		 507 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  37.09 
 
 		 414 aa  192  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  36.33 
 
 		 514 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  39.5 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  34.54 
 
 		 509 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  39.5 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  36.72 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  39.13 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  36.09 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  36.88 
 
 		 403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.18 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2674  hypothetical protein  36.31 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  36.9 
 
 		 527 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  34.65 
 
 		 507 aa  188  9e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  37.9 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  34.71 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  37.76 
 
 		 506 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  37.76 
 
 		 506 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  36.36 
 
 		 507 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0037  hypothetical protein  38.14 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  37.33 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  36.84 
 
 		 399 aa  186  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  38.46 
 
 		 402 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  36.36 
 
 		 501 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  36.04 
 
 		 401 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  34.62 
 
 		 514 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  39.73 
 
 		 514 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  36.55 
 
 		 517 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  33.77 
 
 		 511 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  35.86 
 
 		 549 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  35.27 
 
 		 526 aa  182  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  40.2 
 
 		 416 aa  182  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  35.35 
 
 		 423 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  33.77 
 
 		 511 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  34.39 
 
 		 423 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  36.01 
 
 		 515 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  35.27 
 
 		 565 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4110  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.22 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  37.29 
 
 		 515 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  33.99 
 
 		 517 aa  180  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  35.05 
 
 		 401 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  35.67 
 
 		 420 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.77 
 
 		 320 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  34.7 
 
 		 420 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3191  hypothetical protein  37.58 
 
 		 350 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  33.76 
 
 		 418 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  34.7 
 
 		 420 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  34.7 
 
 		 420 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  35.59 
 
 		 503 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  34.7 
 
 		 420 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  33 
 
 		 517 aa  178  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  37.29 
 
 		 515 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  36.45 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  37.54 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2325  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.71 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213895 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  35.78 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  34.98 
 
 		 510 aa  177  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1720  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.58 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  38.87 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  36.21 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  37.58 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>