More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4376 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4376  ectoine utilization protein EutB  100 
 
 		 325 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4430  threonine dehydratase  65.81 
 
 		 330 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  64.69 
 
 		 323 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6018  threonine dehydratase  64.06 
 
 		 323 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3864  threonine dehydratase  61.47 
 
 		 330 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  62.81 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  65.45 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  65.45 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0056  threonine dehydratase  60.75 
 
 		 344 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595  hitchhiker  0.00751641 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3469  threonine dehydratase  62.15 
 
 		 324 aa  359  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5519  threonine dehydratase  62.96 
 
 		 333 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0114285 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6650  threonine dehydratase  65.12 
 
 		 323 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.987033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3695  threonine dehydratase  59.62 
 
 		 334 aa  342  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2151  threonine dehydratase  64.65 
 
 		 319 aa  336  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5240  threonine dehydratase  57.94 
 
 		 333 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme beta subunit  52.6 
 
 		 324 aa  298  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0285  threonine dehydratase  58.62 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.832074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2723  threonine dehydratase  54.55 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3175  threonine dehydratase  56.56 
 
 		 318 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.465407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  45.64 
 
 		 402 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  41.32 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  39.31 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  42.41 
 
 		 506 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  42.41 
 
 		 506 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  39.61 
 
 		 402 aa  212  9e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  42.77 
 
 		 358 aa  209  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  42.37 
 
 		 406 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  39.37 
 
 		 514 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.87 
 
 		 315 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.23 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  41.85 
 
 		 403 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  38.54 
 
 		 501 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  37.85 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  36.76 
 
 		 403 aa  202  9e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  36.68 
 
 		 403 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  41.69 
 
 		 402 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  41.51 
 
 		 401 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  41.51 
 
 		 401 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  37.22 
 
 		 400 aa  199  5e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  36.68 
 
 		 403 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  35.74 
 
 		 403 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  42.68 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  36.08 
 
 		 514 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  42.67 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  36.31 
 
 		 526 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  37.11 
 
 		 507 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  38.75 
 
 		 401 aa  193  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  37.22 
 
 		 509 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.29 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  35.42 
 
 		 403 aa  192  5e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  39.81 
 
 		 415 aa  192  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  33.86 
 
 		 404 aa  192  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  43.05 
 
 		 404 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  36.68 
 
 		 503 aa  192  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  37.69 
 
 		 509 aa  192  9e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  41.69 
 
 		 403 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  40.06 
 
 		 507 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  36.68 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  41.69 
 
 		 403 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  41.74 
 
 		 405 aa  189  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  36.79 
 
 		 403 aa  188  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  36.98 
 
 		 510 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  42.52 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  42.12 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  37.85 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  33.97 
 
 		 511 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  34.94 
 
 		 507 aa  186  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  39.56 
 
 		 402 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4146  hypothetical protein  38.69 
 
 		 320 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  38.8 
 
 		 402 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.66 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  39.43 
 
 		 507 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0008  hypothetical protein  38.69 
 
 		 320 aa  185  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  35.2 
 
 		 403 aa  185  8e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3798  hypothetical protein  38.69 
 
 		 320 aa  185  9e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  39.12 
 
 		 507 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  38.26 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  36.62 
 
 		 504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  41.38 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  43.18 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4110  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.43 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  34.32 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  36.62 
 
 		 504 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  41.88 
 
 		 411 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  39.69 
 
 		 411 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  43.29 
 
 		 401 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  39.43 
 
 		 507 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  38.85 
 
 		 512 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  34.46 
 
 		 408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  38.31 
 
 		 408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  36.33 
 
 		 418 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  37.29 
 
 		 418 aa  182  7e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  38.26 
 
 		 522 aa  182  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  38.93 
 
 		 403 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2325  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.63 
 
 		 333 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213895 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 402 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2674  hypothetical protein  38.54 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  37.54 
 
 		 524 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  37.58 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  41.32 
 
 		 443 aa  180  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>