More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0536 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02966  electron transport complex protein RnfC  71.41 
 
 		 912 aa  858    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002947  electron transport complex protein RnfC  75.04 
 
 		 916 aa  883    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.703595  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1870  electron transport complex protein RnfC  59.69 
 
 		 716 aa  759    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00517809  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0536  electron transport complex protein RnfC  100 
 
 		 773 aa  1561    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000392819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1918  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  51.02 
 
 		 673 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2156  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  51.58 
 
 		 673 aa  591  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2341  electron transport complex protein RnfC  50.13 
 
 		 772 aa  587  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1885  electron transport complex protein RnfC  50.71 
 
 		 704 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2239  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  52.14 
 
 		 703 aa  581  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000974734 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1061  electron transport complex protein RnfC  46.94 
 
 		 659 aa  575  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0936  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  57.73 
 
 		 609 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.787123  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1555  electron transport complex protein RnfC  49.87 
 
 		 732 aa  575  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.555385  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01599  electron transport complex protein RnfC  50.51 
 
 		 740 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105357  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01589  hypothetical protein  50.33 
 
 		 694 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00945839  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2012  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  50.64 
 
 		 740 aa  569  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000275301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2000  electron transport complex protein RnfC  50.51 
 
 		 740 aa  569  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000227688  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1705  electron transport complex protein RnfC  50.2 
 
 		 740 aa  567  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0365167  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1837  electron transport complex protein RnfC  50.33 
 
 		 740 aa  568  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1570  electron transport complex protein RnfC  50.34 
 
 		 676 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1567  electron transport complex protein RnfC  50.06 
 
 		 735 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0379557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2023  electron transport complex protein RnfC  51.52 
 
 		 747 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1818  electron transport complex protein RnfC  50.74 
 
 		 708 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243946  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2967  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  52.73 
 
 		 890 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.390488  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1717  electron transport complex protein RnfC  50.57 
 
 		 735 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1819  electron transport complex protein RnfC  48.64 
 
 		 673 aa  561  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000614228 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2252  electron transport complex protein RnfC  52.04 
 
 		 659 aa  557  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00637467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1627  electron transport complex protein RnfC  50.32 
 
 		 735 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0777449  normal  0.304577 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1896  electron transport complex protein RnfC  53.06 
 
 		 698 aa  558  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.813056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2323  electron transport complex protein RnfC  55.31 
 
 		 737 aa  558  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2008  electron transport complex protein RnfC  52.81 
 
 		 698 aa  558  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02731  electron transport complex protein RnfC  56.49 
 
 		 852 aa  546  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.618008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1402  electron transport complex protein RnfC  55.87 
 
 		 944 aa  538  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.860812 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2401  electron transport complex protein RnfC  53.16 
 
 		 745 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19250  electron transport complex protein RnfC  44.85 
 
 		 688 aa  518  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2197  electron transport complex protein RnfC  51.98 
 
 		 788 aa  506  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1543  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  54.82 
 
 		 981 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2063  electron transport complex protein RnfC  50.88 
 
 		 885 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00525621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2110  electron transport complex protein RnfC  50.88 
 
 		 888 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.524779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2261  electron transport complex protein RnfC  50.69 
 
 		 884 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0443736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2355  electron transport complex protein RnfC  50.97 
 
 		 825 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1832  electron transport complex protein RnfC  50.08 
 
 		 880 aa  492  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0828396 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2275  electron transport complex protein RnfC  50.88 
 
 		 876 aa  492  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169634  normal  0.804532 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4547  electron transport complex protein RnfC  50.69 
 
 		 884 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0736  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  49.71 
 
 		 857 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.200511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2066  electron transport complex protein RnfC  52.19 
 
 		 809 aa  485  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00275367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1909  electron transport complex protein RnfC  52.19 
 
 		 799 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.567258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2170  electron transport complex protein RnfC  51.98 
 
 		 788 aa  482  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0332538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2068  electron transport complex protein RnfC  49.9 
 
 		 870 aa  482  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583585  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2510  electron transport complex protein RnfC  50.88 
 
 		 790 aa  481  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1865  electron transport complex protein RnfC  48.85 
 
 		 731 aa  482  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1173  electron transport complex protein RnfC  49.41 
 
 		 515 aa  476  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2042  electron transport complex protein RnfC  46.67 
 
 		 842 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2174  electron transport complex protein RnfC  49.8 
 
 		 846 aa  475  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1848  electron transport complex protein RnfC  50.1 
 
 		 793 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00264282  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2628  electron transport complex protein RnfC  48.73 
 
 		 532 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2558  electron transport complex protein RnfC  48.75 
 
 		 784 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0669031 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2895  electron transport complex protein RnfC  45.42 
 
 		 523 aa  451  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473495  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1785  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  48.5 
 
 		 567 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1638  electron transport complex protein RnfC  47.29 
 
 		 776 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18920  electron transport complex protein RnfC  47.29 
 
 		 774 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000329645  normal  0.0619935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1034  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  48.68 
 
 		 704 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.321702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1161  electron transport complex protein RnfC  46.12 
 
 		 570 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3234  electron transport complex protein RnfC  43.72 
 
 		 573 aa  398  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1792  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  43.2 
 
 		 541 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2017  electron transport complex protein RnfC  44.66 
 
 		 558 aa  388  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0814  electron transport complex protein RnfC  42.41 
 
 		 515 aa  386  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338019 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0688  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  42.55 
 
 		 605 aa  385  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0508448  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2991  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  43.28 
 
 		 481 aa  353  8e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2822  electron transport complex, C subunit  44.25 
 
 		 495 aa  350  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50960  Electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  43.68 
 
 		 496 aa  348  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228247  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3194  4Fe-4S ferredoxin, RnfC  41.14 
 
 		 517 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3933  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  41.27 
 
 		 517 aa  337  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00505107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3194  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  40.48 
 
 		 519 aa  331  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.8 
 
 		 503 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0263  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC  38.44 
 
 		 437 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14350  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  39.32 
 
 		 441 aa  320  7.999999999999999e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000459992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0079  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.66 
 
 		 443 aa  319  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000481582  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0610  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  40.05 
 
 		 440 aa  317  4e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0321334  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1091  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  41.23 
 
 		 437 aa  307  6e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1571  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.57 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0285  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  40.04 
 
 		 506 aa  306  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51844  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0988  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  40.65 
 
 		 441 aa  302  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0342  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  39.55 
 
 		 445 aa  300  9e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1310  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.94 
 
 		 441 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0680  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  37.07 
 
 		 435 aa  295  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0704  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  36.84 
 
 		 435 aa  294  4e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0387  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.13 
 
 		 435 aa  293  8e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  37.25 
 
 		 440 aa  292  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0552147  hitchhiker  0.00321553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1529  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.48 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.427394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0065  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  40.23 
 
 		 448 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1081  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  36.76 
 
 		 441 aa  283  8.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0983161 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1663  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  35.91 
 
 		 436 aa  281  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1733  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  34.11 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0269079  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1327  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  37.64 
 
 		 439 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000291101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0539  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  35.33 
 
 		 438 aa  274  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1155  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  39.81 
 
 		 441 aa  273  7e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.47563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2593  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  36.89 
 
 		 440 aa  273  9e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0211  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.3 
 
 		 439 aa  270  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507749  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  34.92 
 
 		 454 aa  269  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.521272  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0304  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.02 
 
 		 443 aa  265  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.980459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>