265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1082 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  100 
 
 		 280 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  47.48 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  33.88 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  37.65 
 
 		 268 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  34.45 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  34.31 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  30.38 
 
 		 244 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  30.47 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  34.69 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  30.9 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  32.46 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  29.53 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  28.49 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  29.77 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2007  Ion transport 2 domain protein  31.58 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867159 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  26.07 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  27.43 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  26.29 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  26.29 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  26.29 
 
 		 274 aa  96.3  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  29.56 
 
 		 241 aa  95.9  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  29.73 
 
 		 280 aa  95.9  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  32.7 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1615  Ion transport protein  25.75 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  30.74 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  27.04 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  27.04 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  27.04 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  29.58 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  27.67 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  30.73 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  28.92 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  38.35 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  27.8 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  27.8 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  27.8 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  30.16 
 
 		 328 aa  85.5  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  35.85 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  30.1 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  28.1 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  37.72 
 
 		 517 aa  82  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  35.5 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  33.93 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  26.67 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  33.08 
 
 		 531 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  28.26 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  30.88 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  32.29 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  31.77 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  28.31 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  26.16 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  28.57 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  32.59 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  33.77 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  25.41 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  29.5 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  32.17 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  26.8 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  28.57 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  43.04 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  30.08 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  39.05 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  28.33 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  26.07 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  26.07 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  26.07 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  25.3 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  29.52 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  26.61 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  29.34 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  26.47 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  27.66 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  34.68 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  27.16 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  27.35 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  27.23 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  29.05 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  29.05 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  32.85 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  26.64 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  26.79 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  27.44 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  27.23 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  27.35 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  27.9 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  34.13 
 
 		 509 aa  65.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  32.41 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  33.33 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  27.88 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  29.49 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  25.54 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.09 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  26.92 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  29.26 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  27.27 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  28.99 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  33.03 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>