56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1046 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1046  lysozyme  100 
 
 		 195 aa  401  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  45.45 
 
 		 170 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  36.82 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  36.36 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  33.11 
 
 		 170 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  33.11 
 
 		 170 aa  89  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  33.11 
 
 		 171 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  31.79 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3826  glycoside hydrolase family 24  32.47 
 
 		 181 aa  85.1  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  34.21 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 170 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  32.68 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  31.33 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  29.66 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  31.97 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  32.41 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  30.61 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  29.37 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  27.78 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  29.79 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  29.08 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  28.76 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  29.49 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  29.49 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  31.82 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  29.3 
 
 		 149 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  29.73 
 
 		 154 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  28.67 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  26.71 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  26.71 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  29.01 
 
 		 391 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 		 225 aa  47.8  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 		 225 aa  47.8  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  26.35 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  28.28 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  26.49 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  28.28 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  25.34 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 341 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  25.27 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  26.97 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  25.87 
 
 		 148 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 		 154 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 		 417 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  28.82 
 
 		 583 aa  43.9  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  25.87 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  34.69 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  25.53 
 
 		 158 aa  42  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  27.92 
 
 		 148 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  25.27 
 
 		 167 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  27.92 
 
 		 148 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  27.85 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>