More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0186 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0186  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 408 aa  832    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0515  recombination factor protein RarA  47.01 
 
 		 412 aa  361  1e-98  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl403  recombination factor protein RarA  45.88 
 
 		 410 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  43.81 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf175  recombination factor protein RarA  43.36 
 
 		 402 aa  318  9e-86  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  39.8 
 
 		 422 aa  317  3e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  42.79 
 
 		 424 aa  313  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  42.79 
 
 		 424 aa  313  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  39.7 
 
 		 419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  42.29 
 
 		 423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1846  recombination factor protein RarA  41.06 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  37.08 
 
 		 422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  38.35 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  38.59 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  40.1 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  38.35 
 
 		 428 aa  299  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  39.54 
 
 		 428 aa  299  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  38.11 
 
 		 428 aa  299  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  38.11 
 
 		 428 aa  299  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  38.35 
 
 		 428 aa  299  7e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  39.54 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2501  recombination factor protein RarA  40.96 
 
 		 430 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  37.86 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  39.09 
 
 		 428 aa  292  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  37.86 
 
 		 428 aa  292  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0950  recombination factor protein RarA  38.7 
 
 		 431 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1757  recombination factor protein RarA  36.52 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  36.97 
 
 		 437 aa  263  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  35.31 
 
 		 432 aa  259  6e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  35.9 
 
 		 432 aa  259  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  36.73 
 
 		 444 aa  256  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  37.32 
 
 		 450 aa  256  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  34.22 
 
 		 435 aa  252  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  33.58 
 
 		 441 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  34.22 
 
 		 441 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  34.32 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  34.17 
 
 		 440 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  36.32 
 
 		 443 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  35.58 
 
 		 447 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  34.59 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  33.17 
 
 		 435 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  34.07 
 
 		 420 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  35.24 
 
 		 432 aa  246  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  36.66 
 
 		 439 aa  245  9e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  31.94 
 
 		 423 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 416 aa  244  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  35.7 
 
 		 423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  34.65 
 
 		 455 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  33.25 
 
 		 446 aa  243  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  32.84 
 
 		 447 aa  243  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  35.34 
 
 		 422 aa  242  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  35.17 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  36.63 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  32.68 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  33.17 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  33.33 
 
 		 448 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  35.61 
 
 		 436 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  37.93 
 
 		 441 aa  239  8e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  32.77 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  32.61 
 
 		 461 aa  237  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 448 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  35.21 
 
 		 441 aa  237  4e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  34 
 
 		 735 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  33.25 
 
 		 463 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  33.33 
 
 		 445 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  35.51 
 
 		 428 aa  236  6e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  33.33 
 
 		 445 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  33.33 
 
 		 445 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  33.99 
 
 		 452 aa  235  9e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  34.62 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  34.15 
 
 		 726 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  33.25 
 
 		 731 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  35.25 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  34.47 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.32 
 
 		 734 aa  232  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  31.23 
 
 		 434 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  31.94 
 
 		 432 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  33.65 
 
 		 458 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  32.45 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  33.5 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  35.07 
 
 		 734 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  33.25 
 
 		 494 aa  229  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  34.84 
 
 		 485 aa  229  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  35.1 
 
 		 457 aa  229  7e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  35.66 
 
 		 447 aa  229  7e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  33.17 
 
 		 441 aa  229  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  34.41 
 
 		 438 aa  229  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  35.57 
 
 		 425 aa  229  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  31.23 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  32.27 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  34.91 
 
 		 457 aa  227  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  35.14 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  34.41 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  32.61 
 
 		 459 aa  227  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  35.68 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0991  recombination factor protein RarA  33.25 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  33.67 
 
 		 733 aa  226  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  31.62 
 
 		 477 aa  226  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  33.91 
 
 		 426 aa  226  7e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  32.51 
 
 		 739 aa  226  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>