74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2330 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2330  High-affinity Fe2+/Pb2+ permease-like protein  100 
 
 
325 aa  650    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00178906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  43.98 
 
 
846 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  38.85 
 
 
743 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  42.6 
 
 
820 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  40.22 
 
 
782 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  40.3 
 
 
779 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  33.84 
 
 
413 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  31.06 
 
 
632 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  29.93 
 
 
652 aa  82.4  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  30.83 
 
 
632 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  27.99 
 
 
653 aa  80.1  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  31 
 
 
647 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.08 
 
 
653 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  30 
 
 
631 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  30.34 
 
 
647 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  25.75 
 
 
642 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  25.75 
 
 
642 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  29.82 
 
 
652 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  31.2 
 
 
636 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  28.62 
 
 
633 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  26.57 
 
 
646 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  28.94 
 
 
640 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  27.03 
 
 
640 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  30.77 
 
 
629 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  27.74 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  25.26 
 
 
647 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  26.46 
 
 
642 aa  65.9  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  27.11 
 
 
664 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  27.11 
 
 
683 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  26.71 
 
 
643 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  27.31 
 
 
634 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  26.48 
 
 
649 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  28.21 
 
 
572 aa  60.1  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  28.08 
 
 
634 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  28.22 
 
 
639 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  28.22 
 
 
639 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  28.12 
 
 
660 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  23.86 
 
 
644 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  28.22 
 
 
639 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  23.31 
 
 
280 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.48 
 
 
603 aa  57  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  26.76 
 
 
273 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  27.62 
 
 
657 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  31.25 
 
 
537 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  25.1 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  33.54 
 
 
645 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  31.75 
 
 
396 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  26.78 
 
 
304 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  24.66 
 
 
637 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  25.62 
 
 
652 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  27.35 
 
 
294 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  25.7 
 
 
283 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  28.07 
 
 
647 aa  49.7  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6336  Iron permease FTR1  32.89 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  23.95 
 
 
570 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  21.43 
 
 
691 aa  48.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  23.95 
 
 
570 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  23.1 
 
 
679 aa  47.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  29.88 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1108  FTR1 family iron permease  30.92 
 
 
278 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2722  FTR1 family iron permease  30.92 
 
 
278 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  29.28 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  22.03 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  23.86 
 
 
696 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  23.99 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  25.54 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  22.97 
 
 
281 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  25.79 
 
 
314 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  25.11 
 
 
283 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  25.64 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  26.11 
 
 
308 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  25.64 
 
 
303 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  23.48 
 
 
696 aa  42.7  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  27.5 
 
 
280 aa  42.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>