More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1161 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1161  formyl transferase domain protein  100 
 
 		 292 aa  595  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2249  formyl transferase domain protein  26.85 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  32.37 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0205  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  31.82 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0866  methionyl-tRNA formyltransferase  35.22 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0897  methionyl-tRNA formyltransferase  35.16 
 
 		 303 aa  95.9  7e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  29.86 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  29.77 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2291  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  28.18 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  32.13 
 
 		 309 aa  89.4  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  30.26 
 
 		 313 aa  89  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  30.26 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  30.54 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  35.88 
 
 		 329 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  31.95 
 
 		 327 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  27.56 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  36.6 
 
 		 359 aa  87  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  32.82 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  35.17 
 
 		 322 aa  86.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  37.59 
 
 		 326 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  27.35 
 
 		 316 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  29.9 
 
 		 313 aa  85.9  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  31.69 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  31.6 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  27.98 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  33.1 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  32.1 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  28.44 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  32.91 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  31.33 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  32.41 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  31.28 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  31.65 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  26.64 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  29.72 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2842  methionyl-tRNA formyltransferase  29.78 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.409607  normal  0.026297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  29.94 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  30.04 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  29.94 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  27.67 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  35 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  32.28 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  30.46 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  30.92 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  34.87 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  33.58 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  31.43 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  31.78 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.23 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  30.62 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  30.26 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  27.73 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  28.27 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  32.7 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  34.09 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  28.44 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  29.49 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  28.38 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  33.93 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2023  methionyl-tRNA formyltransferase  30.13 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.030686 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  30.56 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2790  methionyl-tRNA formyltransferase  29.59 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.410887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1236  formyltransferase, putative  25.34 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000369668  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0373  methionyl-tRNA formyltransferase  28.7 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  33.93 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  31.43 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  34.38 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  36.15 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  36.15 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0915  hypothetical protein  29.79 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  28.24 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1168  methionyl-tRNA formyltransferase  30.23 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2588  formyl transferase domain protein  34.06 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  33.5 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0663  methionyl-tRNA formyltransferase  27.5 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  29.05 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1505  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.337969  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  32.69 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  32.05 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  32.08 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0164  methionyl-tRNA formyltransferase  29.87 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  35.17 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  28.37 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  32.69 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  32.69 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  32.69 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  32.69 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1307  methionyl-tRNA formyltransferase  31.43 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  32.69 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  33.54 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  33.54 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  30.36 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  30.48 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  33.49 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  31.87 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  28.84 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  32.92 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  31.97 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>