More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2790 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2790  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 310 aa  633  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.410887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4822  formyl transferase domain protein  72.17 
 
 		 310 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0280468  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2572  methionyl-tRNA formyltransferase  69.9 
 
 		 310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.52335 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0641  methionyl-tRNA formyltransferase  63.84 
 
 		 310 aa  397  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  34.39 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  33.65 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  33.12 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  33.02 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  33.02 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  32.05 
 
 		 316 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  32.17 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  32.17 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  34.55 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  32.81 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  34.01 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  33.23 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  33.12 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  33.23 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  30.89 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  31.83 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  32.18 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  31.29 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  31.85 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  31.53 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  32.78 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  31.55 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  30.28 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  30.89 
 
 		 359 aa  155  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  33.66 
 
 		 299 aa  155  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  32.59 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  30.06 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  29.52 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  33.01 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  31.76 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  32.17 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  30.7 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  31.75 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  31.45 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_002950  PG2023  methionyl-tRNA formyltransferase  31.07 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.030686 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  30.79 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  31.75 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  31.56 
 
 		 315 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  31.56 
 
 		 315 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  32.59 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  32.91 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  31.21 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  31.56 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  31.56 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  31.56 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  31.56 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  31.56 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  32.59 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  31.23 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  32.59 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  30.72 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  31.68 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1524  methionyl-tRNA formyltransferase  30.26 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1642  methionyl-tRNA formyltransferase  30.03 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  32.18 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  30.89 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  30.79 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  30.79 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  30.79 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  30.79 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  30.79 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  30.9 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  29.65 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  29.24 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  30.5 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  29.24 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1386  methionyl-tRNA formyltransferase  30.69 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.442669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  30.56 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  30.51 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  30.79 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  29.81 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  28.39 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  31.91 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  29.21 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  32.67 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  27.88 
 
 		 319 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  29.65 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4113  methionyl-tRNA formyltransferase  32.35 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  31.51 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  28.95 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  32.49 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.229268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  29.65 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0972  methionyl-tRNA formyltransferase  30.79 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.319816  normal  0.276171 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  31.13 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  27.94 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  29.21 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  28.24 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  29.9 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  29.18 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  29.43 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  29.47 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  30.46 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  34.74 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>