More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0641 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0641  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
310 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2790  methionyl-tRNA formyltransferase  63.84 
 
 
310 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.410887  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4822  formyl transferase domain protein  61.89 
 
 
310 aa  394  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0280468  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2572  methionyl-tRNA formyltransferase  59.28 
 
 
310 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.52335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  35.29 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  32.67 
 
 
320 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  31.16 
 
 
311 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  31.93 
 
 
313 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  30.74 
 
 
317 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  32.86 
 
 
317 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1412  putative formyltransferase  31.85 
 
 
311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  30.18 
 
 
318 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  29.82 
 
 
318 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  31.54 
 
 
311 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  31.49 
 
 
311 aa  149  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  31.68 
 
 
315 aa  146  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  30.03 
 
 
316 aa  146  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 
315 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  30.06 
 
 
314 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  29.72 
 
 
312 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  31.76 
 
 
308 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  29.25 
 
 
314 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  30.38 
 
 
311 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  30.38 
 
 
311 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  30.83 
 
 
309 aa  142  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  29.59 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  32.39 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  28.81 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  29.64 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  30.1 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  30.95 
 
 
311 aa  139  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  30.1 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  31.15 
 
 
311 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  29.62 
 
 
313 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  29.25 
 
 
310 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  34.43 
 
 
306 aa  139  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  29.77 
 
 
315 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  31.51 
 
 
301 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4113  methionyl-tRNA formyltransferase  32.27 
 
 
312 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195925  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  29.77 
 
 
315 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  32.73 
 
 
318 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  29.77 
 
 
315 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  29.77 
 
 
315 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  30 
 
 
299 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  29.77 
 
 
315 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  28.91 
 
 
314 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  29.77 
 
 
315 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  29.77 
 
 
315 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  29.49 
 
 
314 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  28.23 
 
 
310 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  28.91 
 
 
310 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  29.26 
 
 
313 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  28.91 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  30.22 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  29.77 
 
 
318 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  28.89 
 
 
309 aa  136  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  28.91 
 
 
314 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  28.91 
 
 
315 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  32.76 
 
 
326 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  29.86 
 
 
319 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  32.35 
 
 
344 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  30.8 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  30.94 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  33.74 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  31.21 
 
 
312 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  31.58 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_002936  DET1642  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 
312 aa  132  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  31.71 
 
 
314 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  31.71 
 
 
314 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  30.86 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  31.09 
 
 
307 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  28.52 
 
 
359 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  31.13 
 
 
315 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  32.93 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  28.32 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_002950  PG2023  methionyl-tRNA formyltransferase  29.01 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.030686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  27.85 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4080  methionyl-tRNA formyltransferase  31.56 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0449  methionyl-tRNA formyltransferase  31.75 
 
 
342 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353128  normal  0.364478 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  32.79 
 
 
315 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  33.46 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  28.23 
 
 
314 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  31.23 
 
 
311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  32.28 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  30.8 
 
 
309 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  29.32 
 
 
317 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  30.8 
 
 
309 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  29.94 
 
 
325 aa  129  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  28.76 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  30.07 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  31.06 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  30.16 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1524  methionyl-tRNA formyltransferase  27.87 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  28.71 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>