More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2572 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2572  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
310 aa  630  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.52335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4822  formyl transferase domain protein  87.42 
 
 
310 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0280468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2790  methionyl-tRNA formyltransferase  69.9 
 
 
310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.410887  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0641  methionyl-tRNA formyltransferase  59.28 
 
 
310 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  31.75 
 
 
311 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  30.89 
 
 
313 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  29.81 
 
 
316 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  30.48 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  29.84 
 
 
317 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  30.06 
 
 
314 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  30.06 
 
 
314 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  30.06 
 
 
314 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  30.06 
 
 
314 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  29.84 
 
 
314 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  30.06 
 
 
314 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  28.98 
 
 
318 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  29.52 
 
 
314 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  29.75 
 
 
314 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  32.21 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  32.21 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  32.21 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  32.21 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  31.65 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  28.66 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  32.21 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  32.21 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  32.21 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  31.33 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  30.06 
 
 
314 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  28.89 
 
 
315 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  30.57 
 
 
311 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  31.54 
 
 
315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  29.74 
 
 
315 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  31.65 
 
 
310 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 
311 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  31.21 
 
 
315 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  31.54 
 
 
315 aa  142  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  29.02 
 
 
314 aa  142  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  31.25 
 
 
308 aa  142  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  31.02 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  28.3 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  31.1 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2023  methionyl-tRNA formyltransferase  28.85 
 
 
323 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.030686 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  30.16 
 
 
313 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 
315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  31.33 
 
 
310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  29.34 
 
 
319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  30.7 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  28.08 
 
 
318 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  32.55 
 
 
318 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  32.32 
 
 
314 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 
328 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0021  methionyl-tRNA formyltransferase  32.59 
 
 
313 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.223082 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  30.38 
 
 
310 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  32.59 
 
 
313 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  33.65 
 
 
325 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4113  methionyl-tRNA formyltransferase  34.45 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195925  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  27.07 
 
 
317 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 
315 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  32.14 
 
 
311 aa  135  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  31.54 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  29.77 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  30.35 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  29.77 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  29.77 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  30.54 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  29.43 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  30.64 
 
 
319 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  30.87 
 
 
320 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  27.91 
 
 
311 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  27.91 
 
 
311 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  31.55 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  31.33 
 
 
308 aa  133  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0449  methionyl-tRNA formyltransferase  31.46 
 
 
342 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353128  normal  0.364478 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4080  methionyl-tRNA formyltransferase  36.55 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67477  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  27.36 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  30.72 
 
 
299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  27.18 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  32.38 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  31.23 
 
 
312 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  28.16 
 
 
316 aa  130  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  31.58 
 
 
312 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  31.27 
 
 
302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  33.44 
 
 
312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  26.33 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  29 
 
 
309 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  29.03 
 
 
313 aa  129  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  27.81 
 
 
315 aa  129  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  32.34 
 
 
307 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  31.37 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  28.24 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  28.48 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  31.35 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  30.06 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0015  methionyl-tRNA formyltransferase  31.33 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.229268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>