More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1168 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1168  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 338 aa  686    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1307  methionyl-tRNA formyltransferase  69.55 
 
 		 338 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14401  putative methionyl-tRNA formyltransferase  59.23 
 
 		 342 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0959  methionyl-tRNA formyltransferase  42.43 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.500083  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10281  putative methionyl-tRNA formyltransferase  43.24 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477504  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09241  putative methionyl-tRNA formyltransferase  44.12 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0403377  hitchhiker  0.00000992021 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10271  putative methionyl-tRNA formyltransferase  42.34 
 
 		 346 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10481  putative methionyl-tRNA formyltransferase  41.76 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.00290754 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0366  methionyl-tRNA formyltransferase  40.83 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09171  putative methionyl-tRNA formyltransferase  41.18 
 
 		 328 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  39.88 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  39.38 
 
 		 333 aa  240  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  39.69 
 
 		 334 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.38 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.902308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  38.71 
 
 		 334 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  44.32 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1769  methionyl-tRNA formyltransferase  37.93 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.161248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  37.94 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  38.15 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  39.75 
 
 		 297 aa  202  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  37.98 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  43.8 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  38.82 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  39.18 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  39.69 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.43 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  37.61 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  42.47 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0449  methionyl-tRNA formyltransferase  43.36 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353128  normal  0.364478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  38.77 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  35.95 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  39.73 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  40.31 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  41.7 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  45.19 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  38.1 
 
 		 329 aa  192  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  37.73 
 
 		 316 aa  192  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  36.68 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  36.47 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  38.49 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  36.81 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  38.73 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  39.69 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.69 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.69 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.69 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  42.47 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  37.65 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  39.69 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4080  methionyl-tRNA formyltransferase  40.69 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67477  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  42.68 
 
 		 309 aa  190  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  39.08 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  39.08 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  37.14 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  39.08 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  39.08 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  35.01 
 
 		 313 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 313 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  37.61 
 
 		 313 aa  189  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  39.33 
 
 		 315 aa  189  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  43.8 
 
 		 307 aa  189  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4113  methionyl-tRNA formyltransferase  45.56 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  36.2 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  38.1 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  32.74 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  38.1 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  39.5 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  42.02 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  37.98 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  41.42 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  41.89 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  41.54 
 
 		 301 aa  186  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  44.4 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  36.2 
 
 		 315 aa  186  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  37.28 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 324 aa  186  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  42.97 
 
 		 310 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  35.5 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  37 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  36.81 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  37.74 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  34.55 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  34.55 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  35.57 
 
 		 311 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  37.42 
 
 		 318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  37.78 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  36.56 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  40.8 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>