More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_09171 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_09171  putative methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
328 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0959  methionyl-tRNA formyltransferase  64.33 
 
 
328 aa  447  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.500083  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10271  putative methionyl-tRNA formyltransferase  63.72 
 
 
346 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10281  putative methionyl-tRNA formyltransferase  62.8 
 
 
328 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477504  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1307  methionyl-tRNA formyltransferase  42.43 
 
 
338 aa  295  6e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1168  methionyl-tRNA formyltransferase  41.47 
 
 
338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14401  putative methionyl-tRNA formyltransferase  39.71 
 
 
342 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10481  putative methionyl-tRNA formyltransferase  42.69 
 
 
336 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.00290754 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0366  methionyl-tRNA formyltransferase  41.96 
 
 
336 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09241  putative methionyl-tRNA formyltransferase  41.42 
 
 
339 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0403377  hitchhiker  0.00000992021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  40.38 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  39.12 
 
 
332 aa  232  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  41.33 
 
 
311 aa  231  9e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  35.58 
 
 
327 aa  225  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 
334 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  35.1 
 
 
334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 
333 aa  222  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3481  methionyl-tRNA formyltransferase  37.85 
 
 
334 aa  218  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.902308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  34.7 
 
 
359 aa  218  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  37.99 
 
 
312 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 
309 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  33.64 
 
 
320 aa  205  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  41.09 
 
 
310 aa  205  9e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  37.99 
 
 
312 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  38.64 
 
 
321 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  35.53 
 
 
311 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  38.14 
 
 
314 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  34.55 
 
 
308 aa  202  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  37.99 
 
 
315 aa  202  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2078  methionyl-tRNA formyltransferase  34.82 
 
 
332 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  36.16 
 
 
309 aa  202  7e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  35.65 
 
 
308 aa  202  9e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  37.86 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  36.98 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  34.43 
 
 
311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  36.98 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  36.69 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  38.1 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1769  methionyl-tRNA formyltransferase  35.71 
 
 
336 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.161248  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  38.11 
 
 
314 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  36.36 
 
 
318 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  36.36 
 
 
318 aa  199  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  34.42 
 
 
318 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  36.51 
 
 
315 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  34.42 
 
 
318 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  34.08 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  34.34 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0897  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  36.36 
 
 
318 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  35.71 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  36.17 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  36.28 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  41.77 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  34.27 
 
 
312 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  36.83 
 
 
315 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  35.5 
 
 
314 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  35.18 
 
 
319 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  33.12 
 
 
317 aa  195  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  39.38 
 
 
310 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 
318 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  40.08 
 
 
314 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  39 
 
 
310 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 
316 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  37.96 
 
 
313 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  36.95 
 
 
310 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0205  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 
303 aa  192  7e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  35.29 
 
 
329 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  38.7 
 
 
310 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  35.5 
 
 
318 aa  192  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  34.81 
 
 
309 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  33.64 
 
 
307 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  34.42 
 
 
318 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  33.01 
 
 
324 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  36.96 
 
 
310 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  32.51 
 
 
312 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  40.08 
 
 
307 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  39 
 
 
310 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  34.64 
 
 
321 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  39.69 
 
 
301 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1386  methionyl-tRNA formyltransferase  38.28 
 
 
315 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.442669  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  34.58 
 
 
302 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  34.64 
 
 
318 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  34.07 
 
 
309 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  36.31 
 
 
332 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  38.04 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  35.51 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  35.29 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  38.04 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  38.04 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  37.38 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  39.29 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  35.28 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  34.42 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  37.25 
 
 
315 aa  190  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  34.21 
 
 
312 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  35.79 
 
 
314 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  34.42 
 
 
318 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  37.13 
 
 
310 aa  189  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  35.11 
 
 
315 aa  189  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>