More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0707 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0707  integral membrane protein MviN  100 
 
 
514 aa  1008    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  38.05 
 
 
514 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  28.35 
 
 
521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  29.42 
 
 
522 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3077  integral membrane protein MviN  30.48 
 
 
543 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112933  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  28.92 
 
 
613 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  28.66 
 
 
541 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  29.09 
 
 
523 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  29.07 
 
 
535 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  29.07 
 
 
535 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  29.09 
 
 
535 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2971  integral membrane protein MviN  29.32 
 
 
525 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053192 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  27.98 
 
 
521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  27.56 
 
 
494 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  30.79 
 
 
531 aa  163  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  27.87 
 
 
521 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  27.87 
 
 
495 aa  158  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  29.67 
 
 
498 aa  156  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  28.09 
 
 
521 aa  156  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  30.24 
 
 
517 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  30.24 
 
 
517 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3190  integral membrane protein MviN  29.09 
 
 
599 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000159661  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  27.36 
 
 
523 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  30.42 
 
 
516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  28.68 
 
 
522 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1523  integral membrane protein MviN  30.96 
 
 
536 aa  154  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  29.09 
 
 
519 aa  153  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  28.29 
 
 
494 aa  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  28.77 
 
 
530 aa  153  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  30.71 
 
 
536 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  30.08 
 
 
534 aa  151  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  25.19 
 
 
529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  26.68 
 
 
522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  29.9 
 
 
518 aa  148  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  28.08 
 
 
521 aa  148  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  26.83 
 
 
514 aa  147  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  29.9 
 
 
524 aa  146  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  26.1 
 
 
512 aa  146  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  28.09 
 
 
513 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  28.67 
 
 
522 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  25.2 
 
 
501 aa  144  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  26.49 
 
 
539 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  25.17 
 
 
525 aa  144  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  26.68 
 
 
534 aa  143  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  29.29 
 
 
511 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  27.33 
 
 
522 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  29.39 
 
 
521 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  25.66 
 
 
528 aa  141  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  29.14 
 
 
533 aa  140  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  28.1 
 
 
522 aa  140  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  29.05 
 
 
521 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 
519 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 
519 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  27.33 
 
 
533 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 
519 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 
519 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 
519 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  28.03 
 
 
542 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  28.03 
 
 
511 aa  137  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  27.27 
 
 
505 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  25.4 
 
 
515 aa  137  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  27.46 
 
 
516 aa  136  7.000000000000001e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  25.74 
 
 
526 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  27.32 
 
 
511 aa  136  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  28.19 
 
 
511 aa  136  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  27.52 
 
 
519 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  30.65 
 
 
528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  29.74 
 
 
524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  27.15 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  26.87 
 
 
512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  25.4 
 
 
515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  24.56 
 
 
511 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  27.15 
 
 
519 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  29.06 
 
 
495 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  28.44 
 
 
520 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  24.89 
 
 
523 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  29.2 
 
 
548 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  25.83 
 
 
517 aa  134  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  25.25 
 
 
511 aa  134  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  26.62 
 
 
512 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  24.66 
 
 
523 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  26.87 
 
 
512 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  26.87 
 
 
512 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  26.18 
 
 
519 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  27.04 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  27.6 
 
 
519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  29.26 
 
 
521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  27.6 
 
 
513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  29.18 
 
 
516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  25.63 
 
 
511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  25.58 
 
 
511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  25.58 
 
 
524 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  25.58 
 
 
511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  25.58 
 
 
511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  25.58 
 
 
511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  25.58 
 
 
511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  25.58 
 
 
524 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  25.58 
 
 
511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  25.58 
 
 
511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>