More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1255 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
276 aa  537  9.999999999999999e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.28 
 
 
268 aa  217  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0268445 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
273 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00426384 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
283 aa  165  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
273 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
280 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7937  ABC transporter (permease)  31.52 
 
 
305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
290 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
274 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.1 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26630  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.99 
 
 
298 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  hitchhiker  0.000776541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3659  sugar ABC transporter, permease protein  27.31 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
305 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255354  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
293 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
305 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 
287 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
297 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
283 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.41 
 
 
302 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0751871  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
283 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
290 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548355  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
283 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
283 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
282 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 
313 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.41 
 
 
292 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
292 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0691  sugar ABC transporter, permease protein, putative  26.72 
 
 
293 aa  102  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0646  putative sugar ABC transporter, permease protein  26.72 
 
 
293 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.313073  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 
293 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0501667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 
299 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2402  ABC transporter membrane spanning protein  26.67 
 
 
317 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
290 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
282 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87004 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 
283 aa  99.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.194848 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.43 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.71 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1115  sugar ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 
285 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0469179  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.18 
 
 
285 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.88 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  26.72 
 
 
283 aa  96.3  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.18 
 
 
285 aa  95.9  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0323033  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.77 
 
 
314 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.54 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18656 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1555  maltose ABC transporter, permease protein, putative  26.18 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555505  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.23 
 
 
293 aa  94  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.464389  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.52 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2127  maltose ABC transporter, permease protein, putative  26.18 
 
 
281 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.82 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3083  ABC transporter, membrane permease  26.18 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0785  carbohydrate ABC transporter permease  26.18 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2617  carbohydrate ABC transporter permease  26.18 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
283 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2995  carbohydrate ABC transporter permease  26.18 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3049  carbohydrate ABC transporter permease  26.18 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1995  carbohydrate ABC transporter permease  26.18 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4073  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  25.82 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3449  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  25.48 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000612368  normal  0.971019 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.82 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.82 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.38 
 
 
291 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.45 
 
 
285 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.86 
 
 
294 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 
285 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  0.12069 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 
281 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.48 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23000  putative permease of ABC sugar transporter  27.99 
 
 
281 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1941  sugar ABC transporter permease  27.99 
 
 
281 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  hitchhiker  0.000196491 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
283 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.628431  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.41 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01770  carbohydrate ABC transporter membrane protein  27.84 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.474975  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.674911  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.14 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.49 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.709264  normal  0.405077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.14 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.13099 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.36 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0152693  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744968  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.07 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6935  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.29 
 
 
300 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
285 aa  89  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.87 
 
 
283 aa  89  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>