More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1169 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
315 aa  630  1e-180  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.77 
 
 
317 aa  339  4e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.46 
 
 
319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.38 
 
 
311 aa  334  9e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.23 
 
 
316 aa  333  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.92 
 
 
319 aa  333  2e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.52 
 
 
325 aa  329  3e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.67 
 
 
317 aa  319  5e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  50.99 
 
 
308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.2 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.92 
 
 
310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.02 
 
 
312 aa  296  2e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.7 
 
 
314 aa  297  2e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.67 
 
 
313 aa  294  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.250586  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.15 
 
 
310 aa  293  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0958657  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  47.42 
 
 
312 aa  291  7e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.05 
 
 
311 aa  291  1e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.25 
 
 
308 aa  288  1e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.98 
 
 
313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.46 
 
 
301 aa  277  2e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.23 
 
 
310 aa  267  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.91 
 
 
311 aa  265  7e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.28 
 
 
309 aa  256  5e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.28 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.03 
 
 
321 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 
313 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.68 
 
 
331 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.69 
 
 
324 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1334  UDP-glucose 4-epimerase  39 
 
 
317 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.297801  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.85 
 
 
333 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
317 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.92 
 
 
313 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.4 
 
 
313 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.16 
 
 
313 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.63 
 
 
321 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.63 
 
 
321 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
302 aa  169  6e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.96 
 
 
327 aa  169  8e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.52 
 
 
317 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.69 
 
 
304 aa  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
292 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.96 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.95 
 
 
314 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 
312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.15 
 
 
309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.71 
 
 
306 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
305 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
292 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  37.13 
 
 
331 aa  159  6e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.87 
 
 
307 aa  159  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.13 
 
 
330 aa  159  7e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.49 
 
 
312 aa  158  9e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
324 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 
304 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 
309 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 
309 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  32.37 
 
 
308 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  36.99 
 
 
298 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  33.75 
 
 
331 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.84 
 
 
307 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  35.09 
 
 
327 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.28 
 
 
309 aa  155  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  34.07 
 
 
328 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
324 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  34.38 
 
 
328 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 
313 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.98 
 
 
324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  35.42 
 
 
328 aa  152  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.91 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  33.76 
 
 
329 aa  152  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.72 
 
 
307 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
310 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
310 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.21 
 
 
325 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.55 
 
 
318 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  33.75 
 
 
328 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 
310 aa  150  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
328 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 
311 aa  150  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
314 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.31 
 
 
318 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6416  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.2 
 
 
323 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955033  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 
372 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 
311 aa  149  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.02 
 
 
325 aa  149  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.28 
 
 
328 aa  149  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.97 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.83 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  35.61 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  34.18 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  33.64 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  33.64 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  32.12 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.93 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>