More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2232 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 
145 aa  283  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  67.94 
 
 
147 aa  186  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  63.64 
 
 
148 aa  167  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  60.15 
 
 
151 aa  160  8.000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  61.54 
 
 
140 aa  158  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  58.52 
 
 
142 aa  158  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  61.07 
 
 
137 aa  152  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  59.52 
 
 
138 aa  140  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  51.85 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  53.73 
 
 
142 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2681  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.63 
 
 
136 aa  120  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00909873  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0790  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.38 
 
 
136 aa  116  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  41.55 
 
 
215 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  45.04 
 
 
498 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  44.27 
 
 
136 aa  106  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  43.94 
 
 
148 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.28 
 
 
136 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  40.58 
 
 
147 aa  104  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2256  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.58 
 
 
128 aa  104  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.829785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.98 
 
 
139 aa  103  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  42.75 
 
 
136 aa  103  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.11 
 
 
141 aa  103  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.48 
 
 
138 aa  103  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.75 
 
 
453 aa  103  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 
135 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.13 
 
 
150 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.35 
 
 
141 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 
136 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  39.69 
 
 
140 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 
223 aa  100  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  41.22 
 
 
136 aa  100  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.22 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  40.6 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.3 
 
 
408 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.6 
 
 
135 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  41.73 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.85 
 
 
143 aa  98.2  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.15 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  40.62 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 
217 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 
217 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 
217 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 
225 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  39.69 
 
 
222 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.36 
 
 
137 aa  94  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.44 
 
 
227 aa  92.8  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.93 
 
 
227 aa  90.9  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  35.21 
 
 
225 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.66 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.35 
 
 
139 aa  88.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  38.97 
 
 
294 aa  88.6  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.94 
 
 
130 aa  87  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  41.04 
 
 
151 aa  83.6  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  37.96 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.78 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.52 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21340  protein-tyrosine-phosphatase  36.64 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.06 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 
347 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  34.62 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  37.23 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  32.33 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.4 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.06 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  37.68 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  36.09 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.89 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 
337 aa  77.4  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.78 
 
 
140 aa  77  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  33.85 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  34.03 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  36.15 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  37.69 
 
 
337 aa  75.5  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  40.57 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.59 
 
 
299 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.12 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.51 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  38.81 
 
 
299 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  43.22 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  39.2 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.35 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  36.92 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.23 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  37.12 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  31.58 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  37.96 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  33.03 
 
 
258 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  33.58 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  33.08 
 
 
133 aa  72  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  35.94 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
275 aa  70.5  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0507  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.78 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  31.3 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  30.83 
 
 
148 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
258 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  32.59 
 
 
588 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  34.09 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>