181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0212 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
337 aa  671    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  39 
 
 
346 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  39.82 
 
 
330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  40.67 
 
 
348 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  37.15 
 
 
334 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  37.23 
 
 
435 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  36.73 
 
 
336 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  37.46 
 
 
337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  40.12 
 
 
348 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  37.72 
 
 
357 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  34.05 
 
 
335 aa  166  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  34.83 
 
 
424 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  34.52 
 
 
379 aa  161  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
345 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  36 
 
 
400 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  33.54 
 
 
374 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  38.91 
 
 
334 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.92 
 
 
332 aa  152  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25420  family 3 adenylate cyclase  34.02 
 
 
362 aa  152  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0567638  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.13 
 
 
371 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1043  adenylate/guanylate cyclase  33.53 
 
 
373 aa  145  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  31.09 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  30.7 
 
 
404 aa  129  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  32.81 
 
 
364 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  32.67 
 
 
378 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  29.7 
 
 
373 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  31.16 
 
 
397 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  32.88 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4452  putative adenylate/guanylate cyclase  32.76 
 
 
373 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54453  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  40.88 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  40.88 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  40.88 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  37.34 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  29.3 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  36.77 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  28.39 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  30.34 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
1046 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
597 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.07 
 
 
622 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  26.1 
 
 
355 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.64 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  29.76 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  30.38 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.07 
 
 
622 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 
411 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  31.72 
 
 
1123 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.57 
 
 
596 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4600  putative adenylate/guanylate cyclase  51.67 
 
 
113 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  32.17 
 
 
315 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  30.86 
 
 
460 aa  57  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  33.6 
 
 
449 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  33.6 
 
 
449 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  33.6 
 
 
449 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.69 
 
 
528 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.81 
 
 
588 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  33.85 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  29.37 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5336  putative adenylate/guanylate cyclase  36.45 
 
 
203 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  29.32 
 
 
1055 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  29.46 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  32.05 
 
 
652 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  29.87 
 
 
279 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  29.87 
 
 
279 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0850  adenylate/guanylate cyclase  23.29 
 
 
278 aa  53.5  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000130568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  29 
 
 
1172 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  27.32 
 
 
684 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  30.53 
 
 
304 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  30.71 
 
 
642 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.06 
 
 
723 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  29.01 
 
 
1156 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  29.57 
 
 
304 aa  52.8  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
626 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  26.7 
 
 
981 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  28.49 
 
 
348 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.19 
 
 
595 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.4 
 
 
577 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.16 
 
 
643 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.85 
 
 
664 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  24.62 
 
 
546 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.5 
 
 
598 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2634  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.77 
 
 
226 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  32.34 
 
 
310 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.14 
 
 
568 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.42 
 
 
1291 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  31.61 
 
 
969 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  29.22 
 
 
275 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  29.71 
 
 
1142 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
469 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  32.81 
 
 
312 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
1094 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  29.11 
 
 
261 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  26.6 
 
 
479 aa  50.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  26.4 
 
 
536 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>