More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1519 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1519  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  632  1e-180  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0546  hypothetical protein  45.63 
 
 
318 aa  296  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1632  hypothetical protein  45.57 
 
 
321 aa  266  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1566  hypothetical protein  45.57 
 
 
321 aa  266  4e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1482  hypothetical protein  40 
 
 
324 aa  241  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.1 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1491  protein of unknown function UPF0118  27.05 
 
 
340 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.961051  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  39.44 
 
 
369 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.48 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  32 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  28.29 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  32.17 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  31.65 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  28.51 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  28.51 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  24.64 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  32.61 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.03 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.03 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  32.61 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.03 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.03 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  32.61 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.03 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.34 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  32.61 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  32.61 
 
 
373 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  32.61 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  28.25 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  32.61 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  32.61 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  32.61 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  21.79 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.93 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  21.79 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  21.79 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1434  hypothetical protein  24.05 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.38 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  21.47 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  22.08 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1480  hypothetical protein  24.05 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.58 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  27.2 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  22.58 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  28.93 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  23.56 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  23.61 
 
 
353 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  25.91 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  25.91 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  25.91 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  25.91 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  25.91 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  25.91 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  28.32 
 
 
424 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  23.04 
 
 
358 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  25.81 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  21.1 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  24.67 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  25.16 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  20.64 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  20.64 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  24.77 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  21.57 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  23.08 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2059  protein of unknown function UPF0118  27.33 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  22.96 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  24.3 
 
 
376 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  26.57 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  24.3 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.61 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5533  hypothetical protein  24.42 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5570  hypothetical protein  24.42 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  21.1 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5291  hypothetical protein  24.42 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5118  membrane protein  24.42 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5133  membrane protein  24.42 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000220099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5618  hypothetical protein  24.42 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5688  hypothetical protein  24.42 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  22.59 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  24.24 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  30.32 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5231  hypothetical protein  26.73 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  26.17 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  21.1 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  22.12 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  21.2 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  21.91 
 
 
345 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  23.18 
 
 
418 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  21.19 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  22.58 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  20.08 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  29.25 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  28.7 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  20.83 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  22.51 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  28.38 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  20.6 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  21.1 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  23.59 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  23.74 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>