More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1509 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1509  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 507 aa  1004    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.832392  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1000  SMC domain-containing protein  43.8 
 
 		 502 aa  409  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  29.7 
 
 		 573 aa  191  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 566 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  26.89 
 
 		 559 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  28.81 
 
 		 573 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0036  DNA repair protein RecN  30.57 
 
 		 532 aa  181  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  31.59 
 
 		 580 aa  181  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  27.52 
 
 		 555 aa  176  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  27.92 
 
 		 577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  29.41 
 
 		 551 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  26.39 
 
 		 553 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  29.23 
 
 		 562 aa  170  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  26.58 
 
 		 553 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  29.26 
 
 		 570 aa  170  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  26.58 
 
 		 553 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  26.58 
 
 		 553 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  26.65 
 
 		 553 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  27.95 
 
 		 558 aa  169  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  28.93 
 
 		 572 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  25.5 
 
 		 556 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  28.39 
 
 		 555 aa  166  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  28.74 
 
 		 529 aa  166  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  30.11 
 
 		 565 aa  166  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  25.42 
 
 		 553 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  28.93 
 
 		 583 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  27.17 
 
 		 561 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  25.6 
 
 		 553 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  25.42 
 
 		 553 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  29.27 
 
 		 579 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  28.91 
 
 		 579 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  27.51 
 
 		 556 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  25.23 
 
 		 553 aa  163  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  25.23 
 
 		 553 aa  163  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  25.23 
 
 		 553 aa  163  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  25.42 
 
 		 553 aa  163  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  26.1 
 
 		 557 aa  163  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  28.75 
 
 		 583 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  25.23 
 
 		 553 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0777  SMC domain-containing protein  28.28 
 
 		 539 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397479  normal  0.58729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  25.05 
 
 		 553 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  29.09 
 
 		 579 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  29.09 
 
 		 579 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  29.09 
 
 		 579 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  26.32 
 
 		 601 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  26.16 
 
 		 553 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  26.99 
 
 		 554 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  28.78 
 
 		 588 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  24.49 
 
 		 553 aa  160  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2596  DNA repair protein RecN  27.05 
 
 		 537 aa  160  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  26.4 
 
 		 577 aa  160  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  28.91 
 
 		 579 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  29.14 
 
 		 557 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  28.73 
 
 		 579 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  28.73 
 
 		 579 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  27.61 
 
 		 557 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  26.42 
 
 		 599 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  28.85 
 
 		 559 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  26.29 
 
 		 560 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  28.85 
 
 		 559 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  25.94 
 
 		 557 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1866  SMC domain-containing protein  24.82 
 
 		 531 aa  157  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  27.48 
 
 		 575 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  28.67 
 
 		 588 aa  156  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  28.44 
 
 		 567 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  25.32 
 
 		 553 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  27.52 
 
 		 555 aa  156  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  26.73 
 
 		 556 aa  155  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  26.06 
 
 		 557 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  25.05 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  27.44 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0781  SMC domain protein  28.4 
 
 		 514 aa  155  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  24.4 
 
 		 591 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  27.61 
 
 		 574 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  26.9 
 
 		 558 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  26.02 
 
 		 557 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  27.83 
 
 		 523 aa  154  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  24.26 
 
 		 553 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  29.48 
 
 		 579 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  30.77 
 
 		 552 aa  153  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  24.95 
 
 		 553 aa  153  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  24.91 
 
 		 553 aa  153  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  24.91 
 
 		 553 aa  153  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  26.87 
 
 		 578 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  26.28 
 
 		 557 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  23.59 
 
 		 565 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  25.05 
 
 		 584 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  26.43 
 
 		 586 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0298  DNA repair protein RecN  29.46 
 
 		 506 aa  152  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  26.05 
 
 		 564 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  28.33 
 
 		 580 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  26 
 
 		 586 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  24.91 
 
 		 553 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  24.05 
 
 		 582 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1084  ATPase  31.37 
 
 		 513 aa  151  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.432799  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1194  DNA repair protein RecN  27.73 
 
 		 555 aa  151  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.544631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  25 
 
 		 553 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  26.64 
 
 		 560 aa  151  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  29.4 
 
 		 588 aa  151  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  23.26 
 
 		 575 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>