181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0983 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0983  trigger factor domain-containing protein  100 
 
 		 435 aa  846    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1108  trigger factor domain-containing protein  42.76 
 
 		 433 aa  312  9e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00276647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0236  trigger factor domain-containing protein  42.96 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0234  trigger factor domain-containing protein  42.96 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0632547  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1708  trigger factor domain-containing protein  34.55 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1569  trigger factor  24.67 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.681108  normal  0.0237303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  25 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  25.13 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  25.41 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  27.07 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  27.07 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  25.41 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  27.07 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  24.15 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  25.95 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  26.17 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  26.17 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  26.17 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  26.17 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  26.17 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  25.55 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  26.17 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  26.17 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  26.17 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  23.8 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  26.09 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  25.9 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  24.27 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  25.56 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  23.76 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  29.17 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  23.67 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  23.13 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  23.13 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  23.13 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  23.13 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  24.14 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  23.81 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  25 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  23 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  23.13 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2406  trigger factor  21.15 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  26.17 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  25.66 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  23.33 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  23.33 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  24.57 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  22.79 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  27.72 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  22.51 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  23.92 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0955  trigger factor  23.24 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0121977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  26.03 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  24.3 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  27.37 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  27.37 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  27.37 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  27.37 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  27.37 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  27.37 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  26.13 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  26.69 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  26.13 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  26.13 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  26.78 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  24.11 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  23.52 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0432  trigger factor-like protein  22.25 
 
 		 449 aa  57  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.746962  normal  0.196981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  27.02 
 
 		 425 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  24.12 
 
 		 432 aa  57  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  25.18 
 
 		 449 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18451  trigger factor  23.78 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.344876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  22.89 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  23.68 
 
 		 458 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1671  trigger factor  24.74 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00079143  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  26.83 
 
 		 449 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  27.02 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  27.02 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  24.49 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  24.32 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  22.05 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  24.01 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  24.01 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  25.58 
 
 		 451 aa  53.9  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  24.05 
 
 		 472 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  23.23 
 
 		 483 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  24.19 
 
 		 433 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  26.81 
 
 		 431 aa  53.5  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  25.51 
 
 		 443 aa  53.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1854  trigger factor  24.57 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.689753  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  25.6 
 
 		 439 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02478  trigger factor  27.75 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0266  trigger factor  24.91 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  21.72 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  23.65 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  23.86 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  24.44 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  23.36 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  21.19 
 
 		 432 aa  51.6  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2008  trigger factor  24.84 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0802148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>