70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0816 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0816  major facilitator transporter  100 
 
 		 357 aa  668    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1549  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 363 aa  136  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  23.43 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  23.43 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  20.06 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 406 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  21.66 
 
 		 425 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  22.63 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  21.62 
 
 		 407 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  23.39 
 
 		 431 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  21.32 
 
 		 386 aa  53.1  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  22.9 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  21.74 
 
 		 419 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  20.47 
 
 		 420 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 395 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  22.8 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  22.39 
 
 		 405 aa  49.3  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  21.71 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  21.07 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3743  hypothetical protein  22.04 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0396479 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 425 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3778  hypothetical protein  22.04 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.974681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3670  hypothetical protein  22.04 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.279689  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0741  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.662794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  21.5 
 
 		 433 aa  47.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 392 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  23.26 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  23.08 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3841  hypothetical protein  22.04 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933183  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  21.11 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  20.23 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  23.25 
 
 		 274 aa  47  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 415 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  22.04 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 394 aa  46.6  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  22.12 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3646  hypothetical protein  22.34 
 
 		 393 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865659  hitchhiker  0.000149858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3740  hypothetical protein  21.99 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3833  hypothetical protein  21.99 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4675  hypothetical protein  21.99 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.398829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0348  major facilitator superfamily MFS_1  21.99 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0348  hypothetical protein  21.99 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3560  hypothetical protein  21.99 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03215  hypothetical protein  21.99 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  23.84 
 
 		 440 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03167  hypothetical protein  21.99 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  19.17 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 410 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  24.53 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2502  hypothetical protein  26.71 
 
 		 394 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.156303  hitchhiker  0.000706101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  18.42 
 
 		 432 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 394 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3272  hypothetical protein  27.56 
 
 		 392 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  19.62 
 
 		 408 aa  42.7  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>