More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0689 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0689  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 443 aa  881    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0119  glycoside hydrolase family 3 protein  36.32 
 
 		 467 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0117  glycoside hydrolase family 3 protein  36.32 
 
 		 465 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  32.4 
 
 		 845 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.06 
 
 		 511 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  32.52 
 
 		 520 aa  153  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.13 
 
 		 698 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  30.12 
 
 		 363 aa  150  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 		 361 aa  149  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  31.73 
 
 		 427 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  31 
 
 		 673 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.58 
 
 		 426 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  32.34 
 
 		 444 aa  139  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.11 
 
 		 598 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  31.9 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.27 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  27.76 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.05 
 
 		 543 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  30.09 
 
 		 633 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.05 
 
 		 511 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.19 
 
 		 478 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.71 
 
 		 600 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  29.77 
 
 		 420 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.42 
 
 		 596 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.35 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.21 
 
 		 534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.1 
 
 		 543 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.21 
 
 		 534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.54 
 
 		 528 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.87 
 
 		 490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  25.88 
 
 		 492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  28.12 
 
 		 336 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  33.1 
 
 		 688 aa  130  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  28.12 
 
 		 356 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  27.59 
 
 		 336 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  29.14 
 
 		 336 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.55 
 
 		 552 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  27.2 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  27 
 
 		 359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  29.14 
 
 		 332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1193  hypothetical protein  28.57 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.76 
 
 		 504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  27 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  30.08 
 
 		 542 aa  128  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.6 
 
 		 580 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  32.24 
 
 		 538 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  32.17 
 
 		 344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  29.45 
 
 		 604 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  29.86 
 
 		 365 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  32.52 
 
 		 531 aa  127  6e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.35 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.65 
 
 		 392 aa  127  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  30.81 
 
 		 528 aa  126  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.43 
 
 		 484 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  33.08 
 
 		 990 aa  126  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  30.71 
 
 		 552 aa  126  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.44 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  28.42 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  32.76 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  26.92 
 
 		 637 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  27.4 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  26.82 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1990  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.79 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.639682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.63 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2346  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.27 
 
 		 361 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1199  hypothetical protein  28 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.05 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  30.55 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  27.2 
 
 		 336 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.79 
 
 		 379 aa  124  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  32.33 
 
 		 538 aa  124  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  28.21 
 
 		 699 aa  124  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1531  glycoside hydrolase family 3 protein  35.74 
 
 		 478 aa  123  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000631966  unclonable  5.75811e-19 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  27.24 
 
 		 699 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  27.56 
 
 		 699 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.19 
 
 		 558 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  27.9 
 
 		 365 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  27.88 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.81 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  27.24 
 
 		 699 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  30.45 
 
 		 631 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  27.67 
 
 		 734 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  29.69 
 
 		 327 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.27 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  29.07 
 
 		 618 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  27.88 
 
 		 360 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.71 
 
 		 362 aa  119  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.27 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  25.4 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  27.95 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  28.42 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  26.9 
 
 		 499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  35.87 
 
 		 549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  25.08 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  29.1 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  29.01 
 
 		 966 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  29.73 
 
 		 498 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  28.72 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  34.83 
 
 		 544 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>