43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2444 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  157  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6993  AbrB family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781681 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  43.24 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  39.24 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 82 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  32.91 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  40 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  40 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  56.1 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1535  transcriptional regulator, AbrB family  52.5 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0183976  hitchhiker  0.000553685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1055  transcriptional regulator, AbrB family  40 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155032  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2557  transcriptional regulator, AbrB family  33.77 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  47.62 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0622  transcriptional regulator, AbrB family  42 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.758267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1206  transcriptional regulator, AbrB family  42 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000319684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2861  AbrB family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0037  AbrB family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000106166  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 72 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3022  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.62 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 72 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 72 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6766  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.185258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2738  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 73 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.703017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  60 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  60 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0588  transcriptional regulator, AbrB family  36.36 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1619  AbrB family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0687  AbrB family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000068736  unclonable  0.00000000733097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 74 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>