More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2814 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2814  putative dehydrogenase  100 
 
 
349 aa  697    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2703  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  71.63 
 
 
348 aa  498  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4177  alcohol dehydrogenase  60.86 
 
 
358 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.886524  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1681  alcohol dehydrogenase  57.31 
 
 
350 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217905  hitchhiker  0.000000155935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0462  alcohol dehydrogenase  54.86 
 
 
348 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0391  alcohol dehydrogenase  52 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6870  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.71 
 
 
343 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1304  alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
356 aa  188  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.19327  normal  0.319474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4017  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 
368 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1301  galactose 1-dehydrogenase / glucose 1-dehydrogenase  32.88 
 
 
358 aa  155  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0941  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.69 
 
 
360 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000857514  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0797  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.78 
 
 
356 aa  153  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3495  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.77 
 
 
370 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2591  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
370 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.596845  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4392  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0792  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.83 
 
 
366 aa  139  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1146  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.41 
 
 
355 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1714  alcohol dehydrogenase  30.98 
 
 
366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.656799  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.92 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.5 
 
 
354 aa  123  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249944  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.75 
 
 
347 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.82 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  29.63 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3849  alcohol dehydrogenase  29.24 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.36 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  27.97 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4609  putative dehydrogenase  31.23 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.86 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.9 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  27.03 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.38 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.95 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
352 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
352 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  27.55 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  26.15 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0771  alcohol dehydrogenase  26.98 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  27.81 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.47 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.32 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  27.53 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.22 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1659  alcohol dehydrogenase  28.2 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741659  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  31.87 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.86 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  27.12 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.69 
 
 
347 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  27.43 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  26.93 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  25.36 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  26.93 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02880  L-iditol 2-dehydrogenase, putative  27.91 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  26.93 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  27.25 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  32.01 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  28.28 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  26.93 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  26.93 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  25.78 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  26.93 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.09 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  27.37 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.95 
 
 
347 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.7 
 
 
346 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.41 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6852  alcohol dehydrogenase  29.74 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.42 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  23.73 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.42 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  30.48 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.28 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  25.89 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  28.05 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.28 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1805  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.657982  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  26.56 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  27.45 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.3 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1455  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.01 
 
 
351 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  27.76 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.93 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.86 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.72 
 
 
343 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.7 
 
 
349 aa  63.5  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  29.33 
 
 
345 aa  63.2  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2116  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.06 
 
 
373 aa  63.2  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  24.93 
 
 
327 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.68 
 
 
346 aa  63.2  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>