More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4208 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  71.5 
 
 
583 aa  796    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  73.06 
 
 
528 aa  742    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  64.27 
 
 
535 aa  677    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  72.39 
 
 
564 aa  816    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 
574 aa  1168    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  72.57 
 
 
564 aa  819    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  56.46 
 
 
553 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  42.04 
 
 
549 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  43.43 
 
 
532 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  42.15 
 
 
563 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  41.4 
 
 
561 aa  343  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  38.34 
 
 
569 aa  333  4e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  40.64 
 
 
540 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  39.74 
 
 
599 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  42.5 
 
 
547 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  39.58 
 
 
607 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  39.58 
 
 
607 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  39.4 
 
 
608 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  52.41 
 
 
421 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  53.33 
 
 
422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  40.33 
 
 
582 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  38.77 
 
 
565 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  42.78 
 
 
560 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02571  putative GTP-binding protein, transport associated  40.84 
 
 
558 aa  321  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  42.61 
 
 
490 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  39.93 
 
 
546 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  41.51 
 
 
580 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  42.17 
 
 
557 aa  312  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  37.72 
 
 
560 aa  311  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0382  putative GTP-binding protein, transporter associated  39.31 
 
 
555 aa  307  3e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.506856  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  47.85 
 
 
430 aa  306  9.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  48.91 
 
 
482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  38.27 
 
 
596 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.65 
 
 
442 aa  300  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  44.11 
 
 
441 aa  299  7e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  51.89 
 
 
414 aa  299  8e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  47.16 
 
 
429 aa  299  9e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  50.14 
 
 
487 aa  298  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  49.32 
 
 
493 aa  297  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1009  GTP-binding protein  40.92 
 
 
555 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2311  putative GTP-binding protein, transporter associated  38.54 
 
 
558 aa  295  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.303102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  37.23 
 
 
555 aa  292  9e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  41.34 
 
 
557 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  46.31 
 
 
429 aa  292  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  46.15 
 
 
425 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  46.49 
 
 
417 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  50.73 
 
 
395 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  45.56 
 
 
424 aa  291  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.25 
 
 
493 aa  291  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  46.31 
 
 
429 aa  291  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  48.8 
 
 
503 aa  291  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  45.56 
 
 
425 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  35.92 
 
 
597 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  44.63 
 
 
435 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  48.61 
 
 
415 aa  290  6e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  45.56 
 
 
425 aa  289  7e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  35.92 
 
 
597 aa  290  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  45.56 
 
 
354 aa  289  9e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  45.56 
 
 
425 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  45.53 
 
 
434 aa  289  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  45.56 
 
 
425 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  43.97 
 
 
435 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  44.16 
 
 
428 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  43.53 
 
 
423 aa  287  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  45.56 
 
 
414 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  46.35 
 
 
432 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  44.44 
 
 
433 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  44.08 
 
 
441 aa  286  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  44.16 
 
 
458 aa  286  5.999999999999999e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  46.31 
 
 
426 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  46.31 
 
 
426 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  46.31 
 
 
426 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  46.31 
 
 
426 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  46.31 
 
 
426 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  45.56 
 
 
414 aa  286  9e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.54 
 
 
516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  46.76 
 
 
426 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  44.97 
 
 
425 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  48.93 
 
 
509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  44.63 
 
 
426 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  45.62 
 
 
415 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.89 
 
 
444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  43.43 
 
 
433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  46.02 
 
 
426 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  46.02 
 
 
426 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  46.02 
 
 
426 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  46.02 
 
 
426 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  46.02 
 
 
426 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  46.02 
 
 
426 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  46.02 
 
 
426 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  46.02 
 
 
426 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  45.7 
 
 
431 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  44.64 
 
 
406 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  44.83 
 
 
428 aa  283  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  45.22 
 
 
439 aa  283  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  44.13 
 
 
432 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  46.02 
 
 
426 aa  282  9e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  45.53 
 
 
435 aa  282  9e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  47.06 
 
 
426 aa  282  9e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  46.83 
 
 
521 aa  282  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>