More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3793 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  70.5 
 
 
443 aa  696    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3116  Pheophorbide a oxygenase  65.91 
 
 
442 aa  646    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  74.49 
 
 
442 aa  716    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3793  pheophorbide a oxygenase  100 
 
 
443 aa  920    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  35.41 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  35.37 
 
 
477 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  33.92 
 
 
499 aa  236  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  35.44 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.88 
 
 
497 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  34.76 
 
 
492 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2189  Pheophorbide a oxygenase  34.55 
 
 
474 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477289 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.56 
 
 
497 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  35.8 
 
 
461 aa  226  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  36.03 
 
 
456 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  34.9 
 
 
438 aa  206  9e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  33.1 
 
 
498 aa  205  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.71 
 
 
450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  32.7 
 
 
668 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.47 
 
 
450 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40637  predicted protein  29.21 
 
 
510 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0964  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.9 
 
 
468 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3338  Rieske (2Fe-2S) region  77.94 
 
 
79 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  35.2 
 
 
334 aa  91.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  32.43 
 
 
361 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
373 aa  87  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.86 
 
 
367 aa  87  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.9 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.3 
 
 
337 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  29.67 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  34.25 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08721  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  22.86 
 
 
440 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.41 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  27.51 
 
 
370 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.37 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  25.43 
 
 
366 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08501  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  23.43 
 
 
444 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.48 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.08 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.29 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.18 
 
 
449 aa  80.1  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  26.91 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  28.8 
 
 
349 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  25.96 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  27.44 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  30.61 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.57 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0218  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  23.19 
 
 
444 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.163513  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  28.22 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  28.14 
 
 
407 aa  77  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08691  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  20.34 
 
 
440 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  30.46 
 
 
452 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.87 
 
 
356 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09481  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  22.47 
 
 
448 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.056748  hitchhiker  0.0000260646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  31.61 
 
 
452 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.28 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  24.64 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  27.2 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  29.14 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.16 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.55 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  24.29 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.16 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  25.89 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  27.87 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  30.22 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.68 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  25.23 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  32.29 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  30.67 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.77 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  30.26 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  29.87 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.97 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  28.73 
 
 
338 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.73 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  22.73 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.14 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.32 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.94 
 
 
353 aa  73.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.19 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.48 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.89 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.54 
 
 
326 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07721  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  21.94 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.725202  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.4 
 
 
364 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.73 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0817  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  20.44 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.47807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.14 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  35.03 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  26.98 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.36 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.36 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.36 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.36 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.34 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  30.18 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.14 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.36 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  26.09 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>