51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1574 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1574  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase small subunit  100 
 
 		 423 aa  864    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3903  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase small subunit  62.56 
 
 		 414 aa  545  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2132  ribulose bisphosphate carboxylase small chain  59.86 
 
 		 408 aa  528  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0344956  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4299  ribulose bisphosphate carboxylase small chain  57.92 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31184  predicted protein  58.48 
 
 		 415 aa  360  3e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0093852  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37239  predicted protein  41.39 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00188315  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3956  predicted protein  42.02 
 
 		 342 aa  204  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  31.9 
 
 		 552 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  52.87 
 
 		 675 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1423  carbonate dehydratase  31.31 
 
 		 539 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0536708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  47.42 
 
 		 666 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  47.42 
 
 		 666 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  38.1 
 
 		 556 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1615  Carbonate dehydratase  48.31 
 
 		 650 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  41.18 
 
 		 672 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  27.8 
 
 		 460 aa  53.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  26.77 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  27.4 
 
 		 803 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  28.92 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36081  predicted protein  31.19 
 
 		 366 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  27.39 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  27.97 
 
 		 685 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  25.49 
 
 		 722 aa  47  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  26.28 
 
 		 713 aa  46.6  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  22.93 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  29.34 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  28.67 
 
 		 284 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  28.48 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  27.07 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  28.9 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  24.9 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  27.27 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  26.78 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  25.67 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  29.12 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  28.48 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  26.99 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  26.92 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  25 
 
 		 832 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.190339 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  28.73 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  25.75 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  26.71 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.14 
 
 		 805 aa  44.3  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  27.89 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  27.11 
 
 		 465 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.69 
 
 		 759 aa  43.5  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  25.62 
 
 		 403 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  27.33 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  27.23 
 
 		 438 aa  43.1  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  25.75 
 
 		 488 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  27.63 
 
 		 403 aa  43.1  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>