16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4299 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4299  ribulose bisphosphate carboxylase small chain  100 
 
 
423 aa  866    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3903  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase small subunit  62.41 
 
 
414 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2132  ribulose bisphosphate carboxylase small chain  60.28 
 
 
408 aa  521  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0344956  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1574  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase small subunit  57.92 
 
 
423 aa  503  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31184  predicted protein  56.06 
 
 
415 aa  342  9e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0093852  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37239  predicted protein  39.74 
 
 
381 aa  218  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00188315  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3956  predicted protein  46.12 
 
 
342 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1615  Carbonate dehydratase  48.11 
 
 
650 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  45.3 
 
 
666 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  45.3 
 
 
666 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  38.21 
 
 
552 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  34.81 
 
 
556 aa  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1423  carbonate dehydratase  45.24 
 
 
539 aa  89  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0536708  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  45.54 
 
 
675 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  41.84 
 
 
672 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  24.66 
 
 
460 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0288941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>