More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4469 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  100 
 
 		 556 aa  1138    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  75.09 
 
 		 552 aa  840    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  58.27 
 
 		 666 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  58.27 
 
 		 666 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  54.01 
 
 		 672 aa  616  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  53.11 
 
 		 675 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1423  carbonate dehydratase  50 
 
 		 539 aa  536  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0536708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1615  Carbonate dehydratase  48.93 
 
 		 650 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3020  carbonic anhydrase  37.76 
 
 		 248 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.510523  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1842  carbonic anhydrase  39.38 
 
 		 205 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873824  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0684  carbonate dehydratase  36.41 
 
 		 183 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.125952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3903  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase small subunit  52.34 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2132  ribulose bisphosphate carboxylase small chain  57.45 
 
 		 408 aa  120  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0344956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0826  hexapaptide repeat-containing transferase  38.76 
 
 		 186 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2615  hypothetical protein  37.85 
 
 		 186 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.294224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3652  carbonic anhydrase  40.45 
 
 		 186 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0664079  normal  0.293662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0319  carbonic anhydrase  39.33 
 
 		 186 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6342  hypothetical protein  38.98 
 
 		 186 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0930  carbonic anhydrase  38.76 
 
 		 186 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1102  carbonic anhydrase  38.76 
 
 		 186 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682756  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73060  hypothetical protein  38.98 
 
 		 186 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4939  carbonic anhydrase  37.64 
 
 		 186 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.073518  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5662  hexapaptide repeat-containing transferase  38.2 
 
 		 186 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3037  carbonic anhydrase  37.64 
 
 		 186 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5329  carbonic anhydrase  37.64 
 
 		 186 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06412  carbonic anhydrase  34.83 
 
 		 177 aa  102  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1574  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase small subunit  42.11 
 
 		 423 aa  100  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29200  Trimeric LpxA-like superfamily protein  35.59 
 
 		 186 aa  98.6  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2579  carbonic anhydrase-related protein  36.16 
 
 		 186 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2270  hexapaptide repeat-containing transferase  36.16 
 
 		 186 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11927  normal  0.0994885 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2627  carbonic anhydrase-related protein  33.71 
 
 		 186 aa  97.4  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151776  normal  0.469005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4299  ribulose bisphosphate carboxylase small chain  38.89 
 
 		 423 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1465  hexapaptide repeat-containing transferase  33.84 
 
 		 204 aa  90.1  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0469  carbonic anhydrase  31.28 
 
 		 273 aa  89.7  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  36.17 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  38.97 
 
 		 176 aa  76.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  35.9 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  38.93 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15870  hypothetical protein  31.47 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  38.52 
 
 		 196 aa  73.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  30.77 
 
 		 174 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3654  hexapaptide repeat-containing transferase  31.39 
 
 		 177 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443395  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3408  carbonic anhydrase  30.07 
 
 		 174 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50052  normal  0.517344 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  32.81 
 
 		 194 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  34.62 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2168  hexapaptide repeat-containing transferase  35.07 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1450  hexapaptide repeat-containing transferase  35.07 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.292844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  33.8 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  32.58 
 
 		 173 aa  69.7  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  33.33 
 
 		 195 aa  70.1  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  35.29 
 
 		 174 aa  70.1  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  37.4 
 
 		 154 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.47 
 
 		 166 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1667  hypothetical protein  31.64 
 
 		 184 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2707  acetyltransferase protein  32.09 
 
 		 176 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  30.88 
 
 		 174 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  31.68 
 
 		 175 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4906  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  35.07 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  33.08 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  33.83 
 
 		 177 aa  68.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  32.39 
 
 		 173 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  31.06 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  35.07 
 
 		 183 aa  67  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3074  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.03 
 
 		 181 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  31.06 
 
 		 175 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0585  hexapaptide repeat-containing transferase  31.87 
 
 		 187 aa  67  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  35.25 
 
 		 199 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.59 
 
 		 174 aa  67  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_002978  WD0466  hexapeptide transferase family protein  37.41 
 
 		 171 aa  66.6  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  31.79 
 
 		 179 aa  66.6  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  29.5 
 
 		 174 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  37.06 
 
 		 183 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  29.75 
 
 		 174 aa  65.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  33.8 
 
 		 174 aa  65.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0836  carbonic anhydrase  32.14 
 
 		 178 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871401 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1622  ferripyochelin binding protein  33.58 
 
 		 167 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000492674  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 		 176 aa  65.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0880  isoleucine cluster protein  32.35 
 
 		 166 aa  65.1  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  33.33 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  28.87 
 
 		 171 aa  65.5  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  32.61 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1326  hypothetical protein  30.94 
 
 		 177 aa  65.1  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  0.329427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  34.43 
 
 		 199 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  29.71 
 
 		 174 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  29.59 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2377  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.58 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  30.94 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  29.93 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  33.33 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0961  ferripyochelin binding protein  31.16 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  33.33 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0832  hexapaptide repeat-containing transferase  31.94 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  33.33 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0817  transferase  31.94 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  34.96 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1903  hexapeptide repeat-containing transferase  32.84 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000422346  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1414  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.07 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000109876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  32.79 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2735  acetyltransferase  30.3 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  32.79 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>