More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3652 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3652  carbonic anhydrase  100 
 
 
186 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0664079  normal  0.293662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0319  carbonic anhydrase  87.1 
 
 
186 aa  329  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4939  carbonic anhydrase  83.87 
 
 
186 aa  320  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.073518  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3037  carbonic anhydrase  83.33 
 
 
186 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5329  carbonic anhydrase  83.33 
 
 
186 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1102  carbonic anhydrase  81.72 
 
 
186 aa  312  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682756  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6342  hypothetical protein  73.66 
 
 
186 aa  287  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0826  hexapaptide repeat-containing transferase  75.81 
 
 
186 aa  286  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73060  hypothetical protein  73.12 
 
 
186 aa  284  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134942  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0930  carbonic anhydrase  74.73 
 
 
186 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5662  hexapaptide repeat-containing transferase  73.12 
 
 
186 aa  277  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2615  hypothetical protein  67.2 
 
 
186 aa  265  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.294224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2579  carbonic anhydrase-related protein  69.89 
 
 
186 aa  264  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2270  hexapaptide repeat-containing transferase  69.89 
 
 
186 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11927  normal  0.0994885 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2627  carbonic anhydrase-related protein  64.52 
 
 
186 aa  251  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151776  normal  0.469005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29200  Trimeric LpxA-like superfamily protein  67.74 
 
 
186 aa  251  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06412  carbonic anhydrase  57.63 
 
 
177 aa  218  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0684  carbonate dehydratase  37.57 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.125952  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  38.59 
 
 
672 aa  120  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1465  hexapaptide repeat-containing transferase  33.17 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  38.33 
 
 
675 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  39.13 
 
 
552 aa  116  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  38.59 
 
 
666 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  38.59 
 
 
666 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0469  carbonic anhydrase  34.78 
 
 
273 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  40.45 
 
 
556 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3020  carbonic anhydrase  31.98 
 
 
248 aa  97.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.510523  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1842  carbonic anhydrase  33.66 
 
 
205 aa  96.3  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873824  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1615  Carbonate dehydratase  39.01 
 
 
650 aa  94.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  35.33 
 
 
177 aa  91.3  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  34.71 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  34.12 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  32.16 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1423  carbonate dehydratase  31.72 
 
 
539 aa  89  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0536708  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  33.53 
 
 
174 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  33.53 
 
 
174 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  33.53 
 
 
174 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  30.59 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  32.94 
 
 
174 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  32.94 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  32.94 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  35.42 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.48 
 
 
166 aa  84  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  36.25 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  38.93 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  37.19 
 
 
174 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  37.19 
 
 
174 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  37.19 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  37.19 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1686  hexapeptide repeat-containing transferase  37.19 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0376893  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3129  hexapeptide repeat-containing transferase  37.19 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.316555  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  37.19 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0064  putative acetyltransferase/acyltransferase  31.06 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.949826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  31.14 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  34.85 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.97 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  37.5 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  34.73 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1427  carbonic anhydrase  31.85 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  36.97 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  38.81 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  34.35 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0032  hexapeptide repeat-containing transferase  30.43 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.1 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  31.61 
 
 
194 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  31.21 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  30.95 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4073  acetyltransferase/carbonic anhydrase  38.97 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.213476  hitchhiker  0.00780432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  36.09 
 
 
232 aa  78.2  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  34.64 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  38.89 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  37.9 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2539  hexapaptide repeat-containing transferase  40.32 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415696  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  34.06 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  38.33 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  35.93 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  33.55 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  29.7 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  30.34 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0023  hypothetical protein  35.38 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.727004  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  30.12 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  29.03 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000362772  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1667  hypothetical protein  33.82 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  28.89 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  28.16 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  34 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  32.47 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  32.47 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  36.36 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  31.74 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  34.3 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.59 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  32.89 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  37.4 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  37.4 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  37.4 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  38.28 
 
 
177 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  33.59 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>