More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1842 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1842  carbonic anhydrase  100 
 
 
205 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873824  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3020  carbonic anhydrase  53.27 
 
 
248 aa  216  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.510523  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1599  Carbonate dehydratase  38.89 
 
 
666 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1624  Carbonate dehydratase  38.89 
 
 
666 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1369  Carbonate dehydratase  39.06 
 
 
675 aa  150  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4469  ribulose bisphosphate carboxylase, small chain  39.38 
 
 
556 aa  148  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97747  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1862  carbonate dehydratase  38.86 
 
 
552 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3849  carbonate dehydratase  35.23 
 
 
672 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226074  normal  0.037707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1423  carbonate dehydratase  42.24 
 
 
539 aa  128  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0536708  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0684  carbonate dehydratase  36.18 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.125952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1615  Carbonate dehydratase  37.97 
 
 
650 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73060  hypothetical protein  34.45 
 
 
186 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134942  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6342  hypothetical protein  33.01 
 
 
186 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5662  hexapaptide repeat-containing transferase  33.49 
 
 
186 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1102  carbonic anhydrase  33.49 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682756  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06412  carbonic anhydrase  31.22 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3652  carbonic anhydrase  33.66 
 
 
186 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0664079  normal  0.293662 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2615  hypothetical protein  32.81 
 
 
186 aa  96.3  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.294224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3037  carbonic anhydrase  33.97 
 
 
186 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5329  carbonic anhydrase  33.97 
 
 
186 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2579  carbonic anhydrase-related protein  33.16 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2270  hexapaptide repeat-containing transferase  33.16 
 
 
186 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11927  normal  0.0994885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4939  carbonic anhydrase  33.97 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.073518  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0319  carbonic anhydrase  34.15 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2627  carbonic anhydrase-related protein  30.69 
 
 
186 aa  92.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151776  normal  0.469005 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0930  carbonic anhydrase  30.24 
 
 
186 aa  91.7  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0826  hexapaptide repeat-containing transferase  30.73 
 
 
186 aa  91.3  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29200  Trimeric LpxA-like superfamily protein  34.2 
 
 
186 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0469  carbonic anhydrase  31.16 
 
 
273 aa  88.6  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0011  acetyltransferase/carbonic anhydrase  30.46 
 
 
169 aa  79  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  38.52 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.39 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  34.39 
 
 
175 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1465  hexapaptide repeat-containing transferase  26.32 
 
 
204 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1253  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  29.44 
 
 
190 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  32.08 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  29.93 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  31.08 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  32.43 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3742  transferase family protein  30.5 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0368075  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1211  hexapeptide transferase family protein  31.74 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.534657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  32.43 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5080  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  31.79 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1599  acetyltransferase/acyltransferase  32.87 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  30.77 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  31.46 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1414  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.23 
 
 
169 aa  67  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000109876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  31.65 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  36.3 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  31.72 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  31.76 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5198  hypothetical protein  33.55 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  33.92 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  36.03 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.66 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  34.03 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  31.08 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4073  acetyltransferase/carbonic anhydrase  29.89 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.213476  hitchhiker  0.00780432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3205  hypothetical protein  33.78 
 
 
174 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  34.46 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  32.24 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  30.77 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04630  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  31.25 
 
 
173 aa  63.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.506175  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  31.08 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  31.08 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1066  hexapeptide transferase family protein  31.07 
 
 
170 aa  63.9  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1720  hexapaptide repeat-containing transferase  34.33 
 
 
174 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  27.27 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0989  transferase  32.12 
 
 
187 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0041  carbonic anhydrase/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily  31.76 
 
 
167 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000415248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  28.97 
 
 
177 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1667  hypothetical protein  28.93 
 
 
184 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  29.17 
 
 
175 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  30.34 
 
 
174 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  31.9 
 
 
173 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1688  carbonic anhydrase  32.89 
 
 
170 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.243557 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  34.23 
 
 
174 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  33.11 
 
 
170 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  31.76 
 
 
174 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0870  transferase  31.39 
 
 
187 aa  62.4  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  33.11 
 
 
170 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  30.38 
 
 
195 aa  62.4  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  33.11 
 
 
170 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  32.67 
 
 
174 aa  62  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1206  carbonic anhydrase  32 
 
 
171 aa  62  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.099516  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  29.05 
 
 
174 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1838  carbonic anhydrase  30.19 
 
 
162 aa  61.2  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222248  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2083  putative acetyltransferase  30.14 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185371  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  31.37 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  31.08 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  36.49 
 
 
172 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  29.21 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  30.14 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  37.19 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  28.26 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.38 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  31.69 
 
 
174 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  29.89 
 
 
171 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  29.27 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1691  carbonic anhydrase  29.44 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>