More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4358 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 		 171 aa  343  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  97.08 
 
 		 176 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  92.4 
 
 		 175 aa  320  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  53.57 
 
 		 203 aa  191  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  57.31 
 
 		 200 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  54.71 
 
 		 208 aa  185  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  54.97 
 
 		 200 aa  185  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  52.35 
 
 		 199 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  52.35 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  50.29 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  52.05 
 
 		 202 aa  178  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  52.35 
 
 		 199 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  50 
 
 		 199 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.82 
 
 		 196 aa  174  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.82 
 
 		 196 aa  174  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.82 
 
 		 196 aa  174  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.54 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.24 
 
 		 196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  47.37 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  49.42 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  47.06 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  50 
 
 		 196 aa  168  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  50 
 
 		 196 aa  167  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  50 
 
 		 196 aa  167  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  50 
 
 		 196 aa  167  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  50 
 
 		 198 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  50 
 
 		 198 aa  167  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  50 
 
 		 198 aa  167  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  50 
 
 		 198 aa  167  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  50 
 
 		 198 aa  167  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  50 
 
 		 196 aa  166  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  50 
 
 		 196 aa  166  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  47.95 
 
 		 222 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  51.23 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  51.23 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  44.38 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  46.15 
 
 		 205 aa  159  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  45.88 
 
 		 196 aa  154  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1903  hexapeptide repeat-containing transferase  40.37 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000422346  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  38.79 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1622  ferripyochelin binding protein  38.51 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000492674  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  38.92 
 
 		 175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  42.86 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.47 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0880  isoleucine cluster protein  46.71 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0041  carbonic anhydrase/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily  36.65 
 
 		 167 aa  124  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000415248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  43.42 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  43.42 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  43.21 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  43.42 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  39.26 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  39.88 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000353278 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  39.62 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  40.68 
 
 		 183 aa  120  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04630  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  44.23 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.506175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0585  hexapaptide repeat-containing transferase  44.81 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  43.12 
 
 		 189 aa  120  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  36.81 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  41.89 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  40.49 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  39.13 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  41.89 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  38.26 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  36.84 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  41.22 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  41.25 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  38.1 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  44.29 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  34.39 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1688  carbonic anhydrase  43.79 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.243557 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  39.62 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  34.97 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0246  carbonic anhydrase  41.51 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1008  ferripyochelin-binding protein  39.26 
 
 		 176 aa  114  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.251932  hitchhiker  0.000436281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2121  carbonic anhydrase  38.89 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.551825  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  37.74 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  33.14 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0108  ferripyochelin binding protein (fbp)  34.94 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000224981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3399  transferase hexapeptide protein  43.42 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  39.31 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.03 
 
 		 163 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  41.72 
 
 		 172 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1631  carbonic anhydrase  38.62 
 
 		 160 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.947333  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  38.82 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1253  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  40.76 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  37.93 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0197  transferase hexapeptide protein  43.33 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.876343  normal  0.740105 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  39.19 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9131  transferase hexapeptide protein  43.54 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  37.75 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5483  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily protein  45.32 
 
 		 184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.754562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1498  carbonic anhydrase  38.6 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  37.75 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  36.81 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  39.62 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  46.38 
 
 		 183 aa  111  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  34.68 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0426  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  39.61 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  38.99 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  35.47 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>